|
|
Принципы структурной организации нуклеиновых кислотp>9.2. Два семейства правых полинуклеотидных спиралей: А и В 247 Краткое содержание................ 259 Глава 10. Структура РНК.................. 260 10.1. Двойные спирали А-РНК и А'-РНК сходны между собой 261 10.2. В тройных спиралях РНК одновременно образуются уотсон-криковские и хугстеновские пары........... 261 10.3. Двойная спираль с параллельными цепями и хугстеновскими парами, образованная poly(U) и 2-замещенным poly (А) . . . 265 10.4. Двойные мини-спирали, образованные ApU и GpC .... 267 10.5. Повороты и изгибы в структуре UpAH+........ 269 Краткое содержание . .............. 271 Глава 11. Структура ДНК..................272 11.1. А-ДНК, единственная представительница А-семейства. Три кристаллических олигонуклеотида А-типа: d(CCGG), d (GGT AT ACC) и d(GGCCGGCC)........... 273 11.2. В-форма полимерных молекул ДНК и додекануклеотида d (CGCGAATTCGCG). Знакомство с двойными спиралями В-семейства.................... 280 11.3. «В-ДНК с чередованием конформации» и тетрануклеотид d(pATAT); d(TpA)-динyклeoзидфocфaт, образующий спирале-подобную структуру................ 284 11.4. Уникальная конформационно жесткая двойная спираль poly (dA)-poly (dT) и ее переход в тройную спираль .... 292 11.5. Двойная спираль С-типа у природных ДНК и синтетических полинуклеотидов................ 292 11.6. D-форму образуют только ДНК, содержащие участки с чередующейся А,Т-последовательностью, и ДНК фага Т2 . . . . 296 11.7. Гибриды ДНК-РНК образуют только двойные спирали типа А- и А'-РНК. Полимеры и олигомер г (GCG) d (TATACGC). 582 Оглавление В-спираль poly (A)-poly (dT).............. 300 Краткое содержание................ 303 Глава 12. Левые комплементарные двойные спирали абсурд? Нет, это семейство Z-ДНК................. . 304 12.1. Кристаллические структуры oligo (dC—dG)-левые двойные спирали.................... 305 12.2. Экстраполяция структурных данных по олигонуклеотидам на случай полинуклеотидов. Z-семейство ДНК: Z-, Zt-, Zn и Z'-ДНК..................... 312 12.3. Левая спираль Z-ДНК в волокнах трех полидезоксинуклео-тидов с чередующейся последовательностью....... 315 12.4. Факторы, стабилизирующие Z-ДНК.......... 315 12.5. Имеют ли Z-ДНК биологическое значение?...... 316 Краткое содержание................. 318 Глава 13. Структура синтетических гомополимеров........ 319 13.1. Правые одноцепочечные спирали со стэкинг-взаимодействи-ем оснований, обнаруженные у полинуклеотида poly (С) и у его 02-метилированного аналога..........321 13.2. Одноцепочечные спирали poly (А) 9-го и 2-го порядков с основаниями «внутри» и «снаружи».......... 324 13.3. Двойная спираль poly (АН+)-poly (АН+) с параллельными цепями, образующаяся при кислых рН. Спираль, поворот и стэкинг пар в димере АрАН+рАН+.......... 328 13.4. Одноцепочечная спираль poly(dT) без стэкинга и с вывернутыми «наружу» основаниями, построенная по данным о структуре дезоксидинуклеотида............ 330 13.5. Антипараллельные двойные спирали А-типа у полинуклеотидов poly(U), poly(s2U) и poly(X).......... 334 13.6. «Липкий» гуанозин. Структура гелей из гуанозина и гуа-ниловой кислоты. Четырехцепочечные спирали poly(G) и poly(I)...................... 337 Краткое содержание ............... 342 Глава 14. Гипотезы и спекуляции: модель «бок о бок», ДНК с изло- ломами и «вертикальная» двойная спираль........ 343 14.1. Можно ли считать модель «бок о бок» альтернативой двойной спирали? ................. 343 14.2. Может ли цепь ДНК сворачиваться путем образования изломов? ...................... 346 14.3. и- и Р-изломы ДНК: «дыхание» со скоростью звука . . . 348 14.4. Изгибы ДНК в месте соединения спиралей А- и В-типа 349 14.5. «Вертикальная» двойная спираль в случае полинуклеотидов с высокой-аннш-конформацией............. 351 Краткое содержание................. 353 Глава 15. тРНК-сокровищница стереохимическои информации.....354 15.1. Первичная и вторичная структура тРНК. «Клеверный лист» 15.2. Свертывание «клеверного листа» в третичную структуру. Г-форма.....................356 15.3. Стабилизация вторичной и третичной структуры тРНК гори- Оглавление 583 зонтальными и вертикальными взаимодействиями между основаниями .................... 357 15.4. Изменение конформации сахара, л-поворот и петля со стэ-кингом «фосфат—основание»: наиболее важные структурные особенности.................... 361 15.5. Некоторые стереохимические корреляции, затрагивающие торсионные углы х, 6 и а, !,............. 364 15.6. Связывание с тРНК катионов металлов и полиаминов . . . 367 15.7. Структура антикодона такова, что он может быстро узнавать кодон, образуя с ним двойную мини-спираль..... 371 15.8. «Оплавленная архитектура» дрожжевой тРНКС1у..... 372 Краткое содержание................ 374 Глава 16. Интеркаляция................... 375 16.1. Основные особенности интеркаляпии в двойные спирали ДНК и РНК................... 375 16.2. Стереохимия интеркаляции в ДНК- и РНК-динуклеозидфос-фаты...................... 379 16.3. Улучшение модели интеркаляции. Комплекс дауномицина с олигонуклеотидом d(CpGpTpApCpG).......... 385 16.4. Экстраполяция моделей интеркаляции на случай ДНК в А- и В-формах.................... 387 16.5. Полностью раскрученная L-ДНК, образующаяся при связывании с платиносодержащим лекарственным препаратом в условиях насыщения. Структура «веревочной лестницы» . . 388 16.6. Актиномицин D-интеркалятор, специфически связывающийся с последовательностью GpC............. 389 Краткое содержание................ 392 Глава 17. Вода и нуклеиновые кислоты............. 393 17.1. Экспериментальные доказательства существования первичных и вторичных гидратных оболочек двойных спиралей ДНК 393 17.2. Разные состояния гидратации А-, В- и С-ДНК..... 396 17.3. Доступная молекулам растворителя поверхность А- и В-ДНК 398 17.4. Теоретические построения.............. 402 17.5. Характер гидратации тетрамера А-ДНК и додекамера В-ДНК в кристаллах и А -»В-переход............404 17.6. Водные пентагоны в кристаллах интеркаляционного комплекса динуклеозидфосфата. Общее представление о циклических водородных связях и «флип-флоп»-механизме....... 407 Краткое содержание................411 Глава 18. Взаимодействия между белками и нуклеиновыми кислотами 413 18.1. Общие соображения относительно нуклеиново-белковых взаимодействий ....................414 18.2. Модельные системы из компонентов белков и нуклеиновых кислот...................... 423 18.3. Модельные системы из нуклеиновых кислот и синтетических полипептидов или протаминов..........428 18.4. При связывании с белками нуклеотиды и одноцепочечные нуклеиновые кислоты приобретают вытянутую форму . . 433 584 Оглавление 18.5. Природа нуклеотидно-белкового и нуклеиново-белкового узнавания ..................... 435 18.6. Белки, связывающиеся с двойными спиралями и одноце-почечными ДНК.................. 450 18.7. Взаимодействие преальбумина с ДНК. Гипотетическая модель ....................... 462 Краткое содержание................. 463 Глава 19. Более высокие уровни структурвой организацнв ДНК .... 464 19.1. Конденсация ДНК с образованием \|/-формы, сверхспиралей, бус, палочкообразных и тороидальных структур..... 464 19.2 Ламеллярные микрокристаллы фрагментированной ДНК . 467 19.3. В клетках ДНК организована в хромосомы...... 469 19.4. Структура нуклеосомной кор-частицы......... 472 19.5. Структурная организация нуклеосом в волокнах диаметром 100 и 300 А. Суперсверхспираль, или соленоид...... 477 19.6. Организация хроматина в хромосоме; транскрипция .... 482 19.7. Топологические проблемы кольцевых замкнутых сверхспиральных ДНК..................... 483 Краткое содержание................. 492 Литература........................ 495 Предметный указатель ... ................ 570 Монография Вольфрам Зенгер ПРИНЦИПЫ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ Научный редактор: Н. Н. Шафрановская Мл. научн. редакторы: Н.Ю. Плавинская, 3. В. Соллертинская Художник В. Е. Карпов Художественный редактор Л. M. Карпов Технический редактор А. Л. Гулина Корректор Н. В. Андреева ИБ № 5719 Сдано в набор 6.05.86. Подписано к печати 30.03.87. Формат 60 х 90'/16. Бумага офсетная № 1. Гарнитура тайме. Печать офсетная. Объем 18,25 бум. л. Усл. печ. л. 36,50. Уел кр. отт. 73,00. Уч.-изд.л. 42,26. Изд. № 4/4312. Тираж 3400 экз. Зак. 509. Цена 6 руб. ИЗДАТЕЛЬСТВО «МИР» 129820, ГСП, Москва И-110, 1-й Рижский пер, 2. Можайский полиграфкомбинат Союзполиграфпрома при Государственном комитете СССР по делам издательств, полиграфии и книжной торговли, г. Можайск, ул. Мира, 93. |
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 |
Скачать книгу "Принципы структурной организации нуклеиновых кислот" (9.68Mb) |
[каталог] [статьи] [доска объявлений] [обратная связь] |