Биологический каталог




Принципы структурной организации нуклеиновых кислот

Автор В.Зенгер

p>9.2. Два семейства правых полинуклеотидных спиралей: А и В 247 Краткое содержание................ 259

Глава 10. Структура РНК.................. 260

10.1. Двойные спирали А-РНК и А'-РНК сходны между собой 261

10.2. В тройных спиралях РНК одновременно образуются уотсон-криковские и хугстеновские пары........... 261

10.3. Двойная спираль с параллельными цепями и хугстеновскими парами, образованная poly(U) и 2-замещенным poly (А) . . . 265

10.4. Двойные мини-спирали, образованные ApU и GpC .... 267

10.5. Повороты и изгибы в структуре UpAH+........ 269

Краткое содержание . .............. 271

Глава 11. Структура ДНК..................272

11.1. А-ДНК, единственная представительница А-семейства. Три кристаллических олигонуклеотида А-типа: d(CCGG),

d (GGT AT ACC) и d(GGCCGGCC)........... 273

11.2. В-форма полимерных молекул ДНК и додекануклеотида d (CGCGAATTCGCG). Знакомство с двойными спиралями В-семейства.................... 280

11.3. «В-ДНК с чередованием конформации» и тетрануклеотид d(pATAT); d(TpA)-динyклeoзидфocфaт, образующий спирале-подобную структуру................ 284

11.4. Уникальная конформационно жесткая двойная спираль

poly (dA)-poly (dT) и ее переход в тройную спираль .... 292

11.5. Двойная спираль С-типа у природных ДНК и синтетических полинуклеотидов................ 292

11.6. D-форму образуют только ДНК, содержащие участки с чередующейся А,Т-последовательностью, и ДНК фага Т2 . . . . 296

11.7. Гибриды ДНК-РНК образуют только двойные спирали типа А- и А'-РНК. Полимеры и олигомер г (GCG) d (TATACGC).

582

Оглавление

В-спираль poly (A)-poly (dT).............. 300

Краткое содержание................ 303

Глава 12. Левые комплементарные двойные спирали абсурд? Нет, это

семейство Z-ДНК................. . 304

12.1. Кристаллические структуры oligo (dC—dG)-левые двойные спирали.................... 305

12.2. Экстраполяция структурных данных по олигонуклеотидам на случай полинуклеотидов. Z-семейство ДНК: Z-, Zt-, Zn и Z'-ДНК..................... 312

12.3. Левая спираль Z-ДНК в волокнах трех полидезоксинуклео-тидов с чередующейся последовательностью....... 315

12.4. Факторы, стабилизирующие Z-ДНК.......... 315

12.5. Имеют ли Z-ДНК биологическое значение?...... 316

Краткое содержание................. 318

Глава 13. Структура синтетических гомополимеров........ 319

13.1. Правые одноцепочечные спирали со стэкинг-взаимодействи-ем оснований, обнаруженные у полинуклеотида poly (С) и

у его 02-метилированного аналога..........321

13.2. Одноцепочечные спирали poly (А) 9-го и 2-го порядков с основаниями «внутри» и «снаружи».......... 324

13.3. Двойная спираль poly (АН+)-poly (АН+) с параллельными цепями, образующаяся при кислых рН. Спираль, поворот и стэкинг пар в димере АрАН+рАН+.......... 328

13.4. Одноцепочечная спираль poly(dT) без стэкинга и с вывернутыми «наружу» основаниями, построенная по данным о структуре дезоксидинуклеотида............ 330

13.5. Антипараллельные двойные спирали А-типа у полинуклеотидов poly(U), poly(s2U) и poly(X).......... 334

13.6. «Липкий» гуанозин. Структура гелей из гуанозина и гуа-ниловой кислоты. Четырехцепочечные спирали poly(G) и

poly(I)...................... 337

Краткое содержание ............... 342

Глава 14. Гипотезы и спекуляции: модель «бок о бок», ДНК с изло-

ломами и «вертикальная» двойная спираль........ 343

14.1. Можно ли считать модель «бок о бок» альтернативой двойной спирали? ................. 343

14.2. Может ли цепь ДНК сворачиваться путем образования изломов? ...................... 346

14.3. и- и Р-изломы ДНК: «дыхание» со скоростью звука . . . 348

14.4. Изгибы ДНК в месте соединения спиралей А- и В-типа 349

14.5. «Вертикальная» двойная спираль в случае полинуклеотидов

с высокой-аннш-конформацией............. 351

Краткое содержание................. 353

Глава 15. тРНК-сокровищница стереохимическои информации.....354

15.1. Первичная и вторичная структура тРНК. «Клеверный лист»

15.2. Свертывание «клеверного листа» в третичную структуру. Г-форма.....................356

15.3. Стабилизация вторичной и третичной структуры тРНК гори-

Оглавление 583

зонтальными и вертикальными взаимодействиями между основаниями .................... 357

15.4. Изменение конформации сахара, л-поворот и петля со стэ-кингом «фосфат—основание»: наиболее важные структурные особенности.................... 361

15.5. Некоторые стереохимические корреляции, затрагивающие торсионные углы х, 6 и а, !,............. 364

15.6. Связывание с тРНК катионов металлов и полиаминов . . . 367

15.7. Структура антикодона такова, что он может быстро узнавать кодон, образуя с ним двойную мини-спираль..... 371

15.8. «Оплавленная архитектура» дрожжевой

тРНКС1у..... 372

Краткое содержание................ 374

Глава 16. Интеркаляция................... 375

16.1. Основные особенности интеркаляпии в двойные спирали ДНК и РНК................... 375

16.2. Стереохимия интеркаляции в ДНК- и РНК-динуклеозидфос-фаты...................... 379

16.3. Улучшение модели интеркаляции. Комплекс дауномицина с олигонуклеотидом d(CpGpTpApCpG).......... 385

16.4. Экстраполяция моделей интеркаляции на случай ДНК в А-

и В-формах.................... 387

16.5. Полностью раскрученная L-ДНК, образующаяся при связывании с платиносодержащим лекарственным препаратом в условиях насыщения. Структура «веревочной лестницы» . . 388

16.6. Актиномицин D-интеркалятор, специфически связывающийся

с последовательностью GpC............. 389

Краткое содержание................ 392

Глава 17. Вода и нуклеиновые кислоты............. 393

17.1. Экспериментальные доказательства существования первичных

и вторичных гидратных оболочек двойных спиралей ДНК 393

17.2. Разные состояния гидратации А-, В- и С-ДНК..... 396

17.3. Доступная молекулам растворителя поверхность А- и В-ДНК 398

17.4. Теоретические построения.............. 402

17.5. Характер гидратации тетрамера А-ДНК и додекамера В-ДНК

в кристаллах и А -»В-переход............404

17.6. Водные пентагоны в кристаллах интеркаляционного комплекса динуклеозидфосфата. Общее представление о циклических

водородных связях и «флип-флоп»-механизме....... 407

Краткое содержание................411

Глава 18. Взаимодействия между белками и нуклеиновыми кислотами 413

18.1. Общие соображения относительно нуклеиново-белковых взаимодействий ....................414

18.2. Модельные системы из компонентов белков и нуклеиновых кислот...................... 423

18.3. Модельные системы из нуклеиновых кислот и синтетических полипептидов или протаминов..........428

18.4. При связывании с белками нуклеотиды и одноцепочечные нуклеиновые кислоты приобретают вытянутую форму . . 433

584

Оглавление

18.5. Природа нуклеотидно-белкового и нуклеиново-белкового узнавания ..................... 435

18.6. Белки, связывающиеся с двойными спиралями и одноце-почечными ДНК.................. 450

18.7. Взаимодействие преальбумина с ДНК. Гипотетическая модель ....................... 462

Краткое содержание................. 463

Глава 19. Более высокие уровни структурвой организацнв ДНК .... 464 19.1. Конденсация ДНК с образованием \|/-формы, сверхспиралей,

бус, палочкообразных и тороидальных структур..... 464

19.2 Ламеллярные микрокристаллы фрагментированной ДНК . 467

19.3. В клетках ДНК организована в хромосомы...... 469

19.4. Структура нуклеосомной кор-частицы......... 472

19.5. Структурная организация нуклеосом в волокнах диаметром

100 и 300 А. Суперсверхспираль, или соленоид...... 477

19.6. Организация хроматина в хромосоме; транскрипция .... 482

19.7. Топологические проблемы кольцевых замкнутых сверхспиральных ДНК..................... 483

Краткое содержание................. 492

Литература........................ 495

Предметный указатель ... ................ 570

Монография

Вольфрам Зенгер

ПРИНЦИПЫ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ

Научный редактор: Н. Н. Шафрановская Мл. научн. редакторы: Н.Ю. Плавинская, 3. В. Соллертинская Художник В. Е. Карпов Художественный редактор Л. M. Карпов Технический редактор А. Л. Гулина Корректор Н. В. Андреева

ИБ № 5719

Сдано в набор 6.05.86. Подписано к печати 30.03.87. Формат 60 х 90'/16. Бумага офсетная № 1. Гарнитура тайме. Печать офсетная. Объем 18,25 бум. л. Усл. печ. л. 36,50. Уел кр. отт. 73,00. Уч.-изд.л. 42,26. Изд. № 4/4312. Тираж 3400 экз. Зак. 509. Цена 6 руб. ИЗДАТЕЛЬСТВО «МИР» 129820, ГСП, Москва И-110, 1-й Рижский пер, 2.

Можайский полиграфкомбинат Союзполиграфпрома при Государственном комитете СССР по делам издательств, полиграфии и книжной торговли, г. Можайск, ул. Мира, 93.

страница 79
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79

Скачать книгу "Принципы структурной организации нуклеиновых кислот" (9.68Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(23.05.2019)