|
|
Ферменты рестрикции и их применениеV GATATC pBR 322 E. coli А Escherichia [54] K514 coli 181 Продолжение таблицы 23 1 2 3 4 5 6 7 8 20 Есо47 II GGNCC pUC 19 E. coli RR1 С Escherichia [2001 coli [200] 21 Есо57 I CTGAAG pJRD 184 E. coli RR1 A Escherichia coli 22 Есо64 I GGPyPuCC pACYC 184 E. coli RR1 A Escherichia [200] coli [200] 23 Есо72 I CACGTG pJRD 184 E. coli RR1 A Escherichia coh [200] 24 Есо98 I AAGCTT pBR 322 E. coli RR1 A Escherichia coli [200] 25 Есо105 I TACGTA pBR 322 E. coli RR1 A Escherichia coli [279] 26 FnuD I GGCC pBR 322 E. coli В Fusobacteri- um nuclea- tum D [36] 27 Fok I GGATG ? ? ? Flavobacte- rium okea- В nokoites 177) 28 Hae II PuGCGCPy pBR 322 E. coli Haemophilus aegyptius [36] 29 HgiA I G(A/T)GC- ? ? ? Herpetosi- (A/T) В phon gigan-teus [37] 30 Hha I GCGC pBR 322 E. coli Haemophi- lus haemo- lyticus [174] 31 Hha II GANTC pBR 322 E. coli A Haemophi- HB101 lus haemo- lyticus [36] 32 Hind III AAGCTT ? ? ? Haemophi- lus influen- zae Rd [190] 33 Hinf I GANTC pUC 19 E. coli ? Haemophi- lus influen- В zae Rf [37] 34 HinP I GCGC pBR 322 E. coli Haemophi- lus iniluen- zae PI [200] 35 Kpn2 I TCCGGA pBR 329 E. coli RR1 С Klebsiella pneumoniae [36. 190] 36 Msp I CCGG ? E. coli ? Moraxella species 37 Nde I CATATG pBR 322 E. coli ? Neisseria [36. denitrificans 190] 38 Not I GCGGCCGC ? E. coli в Nocardia [268] otitidis-ca- viarum [103] 39 PaeR7 CTCGAG pBR 322 E. coli А Pseudomo- MM294 nas aeru- ginosa J162. 40 Pst I CTGCAG pBR 322 E. coli А Providencia HB101 stuartii 284] 182 Продолжение таблицы 23 1 2 3 4 5 6 7 8 41 Pvu 11 CAGCTG ? ? ? Proteus vul- [1901 42 Sal I GTCGAC pIJ 486 Streptomy- A garis Streptomy- [190. ces livi- ces albus G 2231 GG(A/T)CC dans 66 43 Sin I pUC 19 E. coli В Salmonella [139] CCCGGG MC1061 infantis 44 Sma I pACYC 177 E. coli RR1 С Serratia mar- [2001 Taq I TCGA cescens 45 pBR 322 E. coli RR1 В Therm us [2501 46 Xba I TCTAGA pUC 19 E. coli В aquaticus Xanthomo- [279] 47 REco47 GG(A/T)CC pBR 322 E. coli RR1 С nas badrii Escherichia [200]
I 48
RDpn Ie)
GATC
pLS 101
4-RMDpn II
Strep tococ-cuse> pneumoniae (RDpn 1+)
Е
Streptococcus pneumoniae (Diplo-coccus pneumoniae)
[160] ? — данные отсутствуют; a)—коллекционный номер продуцента имеется в [90]; Ь) — точное название штамма-реципиента не указано; с) — методы отбора клонов r+m+; d) —клонированы два тесно сцепленные гена REco47 I-f-MEco47 II с неидентнчной, но перекрывающейся субстратной специфичностью; е) — в соответствии со спецификой рестриктазы Dpn I, она имеется и функционирует в клетках в отсутствие сопряженной метилазы; А — по ограничению фагов; В — по устойчивости рекомбинантных плазмид к действию клонируемой рестриктазы (после ретрансформацин идет проверка бесклеточных экстрактов на наличие рестриктазы); С — как и в случае (В), только последующая проверка на наличие рестриктазы ведется путем проверки ограничения фагов; D — двухступенчатое клонирование для отбора клонов (использовались варианты А, В, С методов отбора и метод молекулярной гибридизации); Е — клонирование путем генетической рекомбинации, d) — продуценты RDpn I и RMDpn II первоначально имели таксономическое название Diplo-cuccus pneumoniae; в настоящее время они переименованы в Streptococcus pneumoniae; е) — рецнпиентным штаммом служил продуцент рестриктазы Ьрп I— (Streptococcus pneumoniae). удалось клонировать гены rm только нескольких систем, в основном локализованных на плазмидах — EcoR I [42], EcoR II J42], Pvu II [51] и PaeR7 [103], что методически явилось более простой задачей, чем клонирование хромосомных генов. Таких на первом этапе было клонировано всего две системы RM— Hha II [174] и Pst I [162, 284]. В последнее время наблюдается прорыв в обсуждаемой области исследований, о чем свидетельствует тот факт, что основная масса генов rm и метилаз 183 Клонированные гены м, принадлежащие к системам рестрикции-модификации ii типа Таблица 24 Ген М Узнаваемая последовательность Вектор Штамм-реци-пиеит Продуцент рестриктазы3) Литература 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 Aat II Alu I Bal I Ban II Bgl I Вер I BspR I Eco47 III Eco88 I Eco56 I FnuD II FnuD III Hae III Hga I Hinc II Hind II Нра II Mva I Mwo I Nae I Nco I QACGTC AGCT TGGGCA GPuGCPyC GCCN5GGC CGCG GGCC AGCGCT CPyCGPuG GCCGGC CGCG GCGC GGCC GACGC GTPyPuAC GTPyPuAC CCGG CC(A/T)GG GCCGGC CCATGG uUC 19 ? ? pBR 322 pBR 327 pACYC 177 pJRD 184 ? pBR 322 pBR 322 pBR 322 pUC 19 pUC 19 pBR 329 pBR 322 pBR 328 E. coli RR1 ? E. coli HB101 E. coli RR1 E. coli RR1 E. coli K802 ? E. coliB> E. coli RR1 E. coii E. coii E. coli E. coliGM31 ? E. coli E. coli Acetobacter aceti Arthrobacter luteus Brevibacte- rium albi- dum Bacillus aneurinoly- ticus Bacillus globigii Brevibacte- rium epider- midis Bacillus sphaericus Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Fusobacte-rium nuclea-tum D Fusobacte-rium nuciea-tum D Haemophilus aegyptius Haemophilus gallinarum Haemophilus influenzae Rc Haemophilus influenzae Rd Haemophilus parain-fluenzae Micrococcus varians Nocardia aerocoloni- genes Nocardia corallina [165] [36, 190] [36, 190] [36, 190} [36, 190] [157] [270] [200] [200] [200] [36, 190] [36, 190] [77] [193] [213] [213] [36, 190] [200] [36] [279] [279] 184 Продолжение таблицы 24
Ген М
Узнаваемая последовательность
Вектор
Штамм-реципиент
Продуцент рестриктазы a)
Литература 1
г
3
4
5
6
7 22 23 24 25
26
NIa III
Nla IV Sau96 I Sph I
Uba26 I
CATG GGNNCC GGNCC GCATGC
GTCTG
? ?
pBR 322 ?
pBR 327
? ?
E. coli RR1 ?
E. coli RR1
Neisseria lactamica Neisseria lactamica Staphylococcus aureus Streptomyces phaeo-chr |
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 |
Скачать книгу "Ферменты рестрикции и их применение" (1.59Mb) |
[каталог] [статьи] [доска объявлений] [обратная связь] |