Биологический каталог




Ферменты рестрикции и их применение

Автор А.А.Янулайтис

V GATATC pBR 322 E. coli А Escherichia [54]

K514 coli 181

Продолжение таблицы 23

1 2 3 4 5 6 7 8

20 Есо47 II GGNCC pUC 19 E. coli RR1 С Escherichia [2001

coli [200]

21 Есо57 I CTGAAG pJRD 184 E. coli RR1 A Escherichia coli 22 Есо64 I GGPyPuCC pACYC 184 E. coli RR1 A Escherichia [200]

coli [200]

23 Есо72 I CACGTG pJRD 184 E. coli RR1 A Escherichia

coh [200]

24 Есо98 I AAGCTT pBR 322 E. coli RR1 A Escherichia

coli [200]

25 Есо105 I TACGTA pBR 322 E. coli RR1 A Escherichia

coli [279]

26 FnuD I GGCC pBR 322 E. coli В Fusobacteri-

um nuclea-

tum D [36]

27 Fok I GGATG ? ? ? Flavobacte-

rium okea-

В nokoites 177)

28 Hae II PuGCGCPy pBR 322 E. coli Haemophilus

aegyptius [36]

29 HgiA I G(A/T)GC- ? ? ? Herpetosi-

(A/T) В phon gigan-teus [37]

30 Hha I GCGC pBR 322 E. coli Haemophi-

lus haemo-

lyticus [174]

31 Hha II GANTC pBR 322 E. coli A Haemophi-

HB101 lus haemo-

lyticus [36]

32 Hind III AAGCTT ? ? ? Haemophi-

lus influen-

zae Rd [190]

33 Hinf I GANTC pUC 19 E. coli ? Haemophi-

lus influen-

В zae Rf [37]

34 HinP I GCGC pBR 322 E. coli Haemophi-

lus iniluen-

zae PI [200]

35 Kpn2 I TCCGGA pBR 329 E. coli RR1 С Klebsiella

pneumoniae [36. 190]

36 Msp I CCGG ? E. coli ? Moraxella

species 37 Nde I CATATG pBR 322 E. coli ? Neisseria [36.

denitrificans 190]

38 Not I GCGGCCGC ? E. coli в Nocardia [268]

otitidis-ca-

viarum [103]

39 PaeR7 CTCGAG pBR 322 E. coli А Pseudomo-

MM294 nas aeru-

ginosa J162.

40 Pst I CTGCAG pBR 322 E. coli А Providencia

HB101 stuartii 284]

182

Продолжение таблицы 23

1 2 3 4 5 6 7 8

41 Pvu 11 CAGCTG ? ? ? Proteus vul- [1901

42 Sal I GTCGAC pIJ 486 Streptomy- A garis Streptomy- [190.

ces livi- ces albus G 2231

GG(A/T)CC dans 66 43 Sin I pUC 19 E. coli В Salmonella [139]

CCCGGG MC1061 infantis 44 Sma I pACYC 177 E. coli RR1 С Serratia mar- [2001

Taq I TCGA cescens

45 pBR 322 E. coli RR1 В Therm us [2501

46 Xba I TCTAGA pUC 19 E. coli В aquaticus Xanthomo- [279]

47 REco47 GG(A/T)CC pBR 322 E. coli RR1 С nas badrii Escherichia [200]

I II Met j

48 RDpn Ie) GATC pLS 101 4-RMDpn II Strep tococ-cuse> pneumoniae (RDpn 1+) Е Streptococcus pneumoniae (Diplo-coccus pneumoniae) [160]

? — данные отсутствуют; a)—коллекционный номер продуцента имеется в [90]; Ь) — точное название штамма-реципиента не указано; с) — методы отбора клонов r+m+; d) —клонированы два тесно сцепленные гена REco47 I-f-MEco47 II с неидентнчной, но перекрывающейся субстратной специфичностью; е) — в соответствии со спецификой рестриктазы Dpn I, она имеется и функционирует в клетках в отсутствие сопряженной метилазы;

А — по ограничению фагов;

В — по устойчивости рекомбинантных плазмид к действию клонируемой рестриктазы (после ретрансформацин идет проверка бесклеточных экстрактов на наличие рестриктазы);

С — как и в случае (В), только последующая проверка на наличие рестриктазы ведется путем проверки ограничения фагов;

D — двухступенчатое клонирование для отбора клонов (использовались варианты А, В, С методов отбора и метод молекулярной гибридизации);

Е — клонирование путем генетической рекомбинации, d) — продуценты RDpn I и RMDpn II первоначально имели таксономическое название Diplo-cuccus pneumoniae; в настоящее время они переименованы в Streptococcus pneumoniae; е) — рецнпиентным штаммом служил продуцент рестриктазы Ьрп I— (Streptococcus pneumoniae).

удалось клонировать гены rm только нескольких систем, в основном локализованных на плазмидах — EcoR I [42], EcoR II J42], Pvu II [51] и PaeR7 [103], что методически явилось более простой задачей, чем клонирование хромосомных генов. Таких на первом этапе было клонировано всего две системы RM— Hha II [174] и Pst I [162, 284]. В последнее время наблюдается прорыв в обсуждаемой области исследований, о чем свидетельствует тот факт, что основная масса генов rm и метилаз

183

Клонированные гены м, принадлежащие к системам рестрикции-модификации ii типа

Таблица 24

Ген М

Узнаваемая последовательность

Вектор

Штамм-реци-пиеит

Продуцент рестриктазы3)

Литература

5 6

7 8 9 10 11

12

13 14 15 16 17

18

19 20

21

Aat II Alu I Bal I

Ban II

Bgl I Вер I

BspR I Eco47 III Eco88 I Eco56 I FnuD II

FnuD III

Hae III Hga I Hinc II Hind II Нра II

Mva I

Mwo I Nae I

Nco I

QACGTC

AGCT

TGGGCA

GPuGCPyC

GCCN5GGC CGCG

GGCC

AGCGCT

CPyCGPuG

GCCGGC

CGCG

GCGC

GGCC

GACGC

GTPyPuAC

GTPyPuAC

CCGG

CC(A/T)GG

GCCGGC

CCATGG

uUC 19 ?

?

pBR 322 pBR 327 pACYC 177 pJRD 184 ?

pBR 322 pBR 322 pBR 322 pUC 19 pUC 19

pBR 329

pBR 322

pBR 328

E. coli RR1 ?

E. coli

HB101 E. coli RR1

E. coli RR1

E. coli K802 ?

E. coliB> E. coli RR1 E. coii E. coii E. coli

E. coliGM31 ?

E. coli E. coli

Acetobacter aceti

Arthrobacter

luteus

Brevibacte-

rium albi-

dum

Bacillus

aneurinoly-

ticus

Bacillus

globigii

Brevibacte-

rium epider-

midis

Bacillus

sphaericus

Escherichia

coli

Escherichia coli

Escherichia coli

Fusobacte-rium nuclea-tum D Fusobacte-rium nuciea-tum D Haemophilus aegyptius Haemophilus gallinarum Haemophilus influenzae Rc Haemophilus influenzae Rd Haemophilus parain-fluenzae Micrococcus varians

Nocardia

aerocoloni-

genes

Nocardia

corallina

[165] [36, 190] [36, 190]

[36, 190}

[36, 190] [157]

[270] [200] [200] [200] [36, 190]

[36, 190]

[77] [193] [213] [213] [36, 190]

[200]

[36] [279]

[279]

184

Продолжение таблицы 24

Ген М Узнаваемая последовательность Вектор Штамм-реципиент Продуцент рестриктазы a) Литература

1 г 3 4 5 6 7

22 23 24 25 26 NIa III Nla IV Sau96 I Sph I Uba26 I CATG GGNNCC GGNCC GCATGC GTCTG ? ? pBR 322 ? pBR 327 ? ? E. coli RR1 ? E. coli RR1 Neisseria lactamica Neisseria lactamica Staphylococcus aureus Streptomyces phaeo-chr

страница 65
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73

Скачать книгу "Ферменты рестрикции и их применение" (1.59Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(14.11.2019)