Биологический каталог




Ферменты рестрикции и их применение

Автор А.А.Янулайтис

м распространении продуцентов рестриктаз (табл. 3) и постоянное пополнение этого списка новыми микроорганизмами (табл. 2) позволяет предположить, что специфические эидоиуклеазы со временем будут обнаружены в большинстве или всех таксонах прокариотических микроорганизмов.

Число обнаруженных в различных таксонах продуцентов рестриктаз сильно варьирует (табл. 3). Наряду с родами, представленными единичными штаммами (Chromatium, Cystoba-cter, Hyphomonas, Hafnia и др.), имеются примеры особо выделяющихся в этом отношении таксонов. В первую очередь это замечание относится к роду Escherichia, в котором обнаружено 236 штаммов, содержащих рестриктазы. Род Bacillus представлен 185 продуцентами, Citrobacter — 43, Streptomyces—42,

2—5933

17

Таблица 3

Распространение продуцентов рестриктаз ь царстве прокариотических микроорганизмов а)

JG части и ее название согласно определителю Берги Род Вин Число продуцентов Всего обнаружено рест» ктаз Охарактеризовано Источник информации

Отдел 1 Цианобактерии б)

Agmnellum Anabaena Anacystis Calothrix Eucapsis Fischerella Fremyella Nostoc Pseudoanabaena Tolypothrix 1 7 1 1 1 1 1 2 1 1 1 15 1 1 1 2 1 15 2 2 1 36 1 1 2 3 2 32 2 2 1 35 I 1 3 2 29 2 2

Отдел II Бактерии в)

1. Фототрофные бактерии 2. Скользящие бактерии 3. Хламидо-бакте- Aphanothece Rhodospirillum Rhodopseudomonas Rhodococcus Chromatium Chloroflexus Spirulina Myxococcus Cystobacter Archangium Podangium Cytophaga Flexibacter Herpetosiphon Sphaerotilus 1 1 I 2 1 1 1 4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 •б 9 1 2 1 15 1 2 1 2 1 12 4 3 1 7 11 1 4 3 17 1 2 1 2 1 19 4 3 7 9 1 4 3 1 16 4 [241 [26J [249J [249} [249] [249] 249] 249} [249]

рии 4. Почкующиеся и/или стебелько- Hyphomonas Caulobacter 1 3 1 3 1 3 1 2

вые бактерии 6. Спиральные и изогнутые бакте- Aquaspirillum Azospirillum 4 2 5 2 8 2 8 1

рии 7. Грамотрицатель-ные аэробные палочки и кокки Pseudomonas Xanthomonas Gluconobacter Rhizobium Agrobacterium Halococcus Halobactenum Alcaligenes Achromobacter Acetobacter Bordetella 12 13 7 3 1 2 3 1 2 4 2 27 15 9 3 7 2 3 5 13 12 2 30 19 10 3 7 2 3 5 13 13 2 26 19 9 1 4 I 5 12 13 2 [48J

18

Продолжение таблицы 3

№ части и ее название согласно определителю Берги Род Вид Число продуцентов Всего обнаружено рест-ктаз Охарактеризовано Источник информации

Thermus 1 4 12 15

8. Грамотрицателъ- Escherichia 1 236 243 144 [190]

иые факультатив- Citrobacter 2 43 44 44 [190]

но анаэробные Salmonella 10 34 34 29 палочки Shigella 2 2 3 3

Klebsiella 2 11 12 12

Erwinia 2 19 20 20

Enterobacter 3 20 24 23

Hafnia 1 1 1 1

Serratia 2 4 4 3

Proteus 2 4 5 5 [24,44]

Providencia 2 2 2 2

Vibrio 4 6 6 6

Aeromonas 1 1 1 1

Chromobacterium 1 1 1 _

Flavobacterium 7 9 10 9

Haemophilus 9 30 45 42

Zymomonas 1 1 1 1

Yersinia 1 6 6 6

9. Грамотрицатель- Fusobacterium 1 6 9 8

ные анаэробные Desulfovibrio 1 2 3 3

бактерии

10 Грамотрицатель- Neisseria 14 37 54 46

ные кокки и кок- Moraxella 6 13 21 16

кобацилы Acinetobacter 2 8 10 10

12. Грамотрицатель- Branhamella 1 1 1 1

Sulfolobus 1 2 2 2

ные хемолито-

трофные бактерии

13. Метаиообразую- Methanococcus 3 3 6 6

щие бактерии Methanobrevibacter 1 1 1 1

Methanobacterium 3 4 4 4

14. Грамположитель- Micrococcus 8 13 13 13

иые кокки Staphylococcus 3 7 8 6

Streptococcus 4 7 7 7 [16]

15. Палочки и кокки, Diplococcus 1 1 2 2

Bacillus 20 185 204 190 [1.24.27.

образующие эндо- Clostridium 8 9 10 9 41]

споры

16. Грамположитель- Caryophanon 1 5 6 4

ные аспорогениые Caseobacter 1 1 1 1

палочки Lactobacillus 1 1 1 1

17. Актиномицеты и Corynebacterium 4 8 9 9

родственные орга- Arthrobacter 3 5 5 5

низмы Brevibacterium 4 4 5 4

Microbacterium 2 2 2 2

Micromonospora 4 4 4 4

Actinomadura 1 1 1 1

Cellulomonas 1 1 1 1

2-

19

Продолжение таблицы 3

№ части и ее название согласно определителю Берги

Род

Вид

Число продуцентов

Всего обнаружено рест-ктаэ

Охарактеризовано

19. Микоплазмы

Thermopolyspora Bifidobacterium Nocardia Strep tomyces Streptoverticillium Thermoplasma Mycoplasma Spiroplasma Ureaplasma

1 7

15 27 2

12 23 42

2

1

1

1

1

1

19 26 51

2

1

1

1

1

1

14 24 43

2

1

1

1

1

А. Неидентифициро-ваниые бактерии

Б. Роды бактерий невошедшие в определитель Берги

В. Хлорелло-подоб-иые зеленые водо-росли

Всего:

Alteromonas Coccochloris Cylindrospermum

Deinococcus Dactylococcopsis Actinosynnema Anabaenopsis Gloeocapsa Gloeothece Gleotricia Desulfococcus Legionella Kluyvera Oerskovia Mastigocladus Methylophilus Microcoleus Synechococcus S'ynechocystic Tuberoidobacter

Tatlockia Thermococ^us Chlorella

117

1 1 2 9 1 1 1 1 1 1 1 2 1 4 1 1 1 2 2 1 1 1

16

1

2

5

13

2

1

2

3

I

3

1

2 1 5 1 1 2 3 5 1 1 1

17

335 1107 1317 1106

1

2

4

13

2

1

2

3

1

2

1

4 t

2 2 3 5 1

1

15

а) Литературным источником сведений, приведенных в таблице, служит список Робертса [319]. Дополнительно указываются ссылки иа сведения, не включенные в данный список.

б) — в таблице оставлены названия родов цианобактерии в том виде, в каком оии приводятся в первоисточниках. Они не всегда соответствуют названиям, принятым в новых вариантах классификации [311] указанных микроограиизмов.

в) классификация бактерий приводится согласно определителю Берги [28].

г) ниже приводятся даииые о продуцентах рестриктаз: А.— неидеитифи-цироваиной таксономической принадлежности; Б. — не вошедших в определитель Бергн; В.— эукариотических.

20

Neisseria — 37, Salmonella — 34, Haemophilus — 30, Nocar-dia — 23 и Enterobacter — 20. Однако, эти сведения сами по себе не могут быть приняты как свидетельство о неравномерной встречаемости рестриктаз в различных родах прокариотических микроорганизмов, так как они являются всего лишь перечнем известных их продуцентов. Неравномерная изученность различных таксонов вполне может найти отражение в неодинаковой представленности штаммов, содержащих специфические эидоиуклеазы, в сравниваемых группах микроорганизмов.

Для обобщений, касающихся вопроса о частоте встречаемости продуцентов рестриктаз в различных таксонах, не

страница 6
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73

Скачать книгу "Ферменты рестрикции и их применение" (1.59Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(12.11.2019)