Биологический каталог




Ферменты рестрикции и их применение

Автор А.А.Янулайтис

ДНК фага ХР12, в то время как Kpnl расщепляет эту ДНК [258], Aval медленно расщепляет неметилированную цепь в гемиметилиро-ванной последовательности CTCGm6AG/CTCGAG [258]. Ball в 50 раз медленнее расщепляет последовательности, перекрывающиеся с участками модифицированными dcm метилазой (TGGCra5CAGG) по сравнению с неметилиро-ваииыми. BanI с различной скоростью расщепляет узнаваемую последовательность в различных позициях которой включен mSC [211, 287]. Bgll с раз-

55

личной скоростью расщепляет определенные т5С гемнметилированные участки (например перекрывающиеся участки MMspI—Bgll н MHpall—Bgll). Однако ш5С диметилированный участок МНаеШ—Bgll полностью устойчив к действию Bgll [211, 274]. BssHII не расщепляет ДНК, модифицированную MHhal, в различных цепях которой гемиметилнроваиы цитознны, находящиеся в различных позициях Gm5GGCGC/GCGm5CGC [258]. MBstI модифицирует внутренний цитозин в последовательности GGATmCC, но пока неизвестно является ли модифицированный продукт ш5С или ш4С [231]. BstEII расщепляет полностью ш5С-замещениую ДНК фага ХР12 [258]. BstNI расщепляем C<"5CWGG, <"5CCWGG n msc^CWGG [258]. Aorl, Apyl, BspNI, Mval и TaqXI — изошизомеры BstNI также не чувствительны к Cm5CWGG [255]. BsuRI расщепляет неметилнрованную цепь в гемиметнлированной последовательности GGm5CC/GGCC [96, 393]. CfrSl, эффекты скорости расщепления приведены в ссылке [106]. Dpnl расщепляет только dam метилированную ДНК. Его нзошизомерами являются Cful [55], Nanll, NmuEI, NmuDI и NsuDl [258]. Dpnl расщепляет ДНК XP12, модифицированную dam метила-зой [276] EcoRI не расщепляет гемиметнлированной последовательности Gm6AATTC/GAATTC. Нн EcoRI, ни RsrI не расщепляет диметилированной последовательности GAm6ATTC/GAm6ATTC [258]. EcoRI расщепляет гемиме-тнлированную последовательность GAATTm5C с пониженной скоростью н не расщепляет олигонуклеотида, в обеих цепях содержащего 5-метилцитозин (GAATTm5C) [91]. EcoRII нзошизомерами, чувствительными к метилированию Cm5CWGG, являются AtuBI, AtuII, BstGIl, BinSI, Cfr5I, CtrlII, EclII, Ecall, Eco27I, Eco38I н MphI [319]. EooRIl ограниченно расщепляет гемн-метилированную последовательность m5CCWGG/CCWGG [410]. EcoRV расщепляет полностью т5С-замещенную ДНК фага ХР12 [258]. Fokl приблизительно 2—4 раза медленнее расщепляет САТСш5С по сравнению с немоди-фицированнымн участками [258]. Haell медленно расщепляет метилированную последовательность RGCGm5CY [211, 287]. Haelll расщепляет неметилнрованную цепь в гемиметнлированной последовательности GGm5CC/GGCC [169]. Hinfl расщепляет GANTm5C, однако скорости расщепления неметилированной. гемиметилированной (GANTm5C/GANTC) и диметилированной (GANTm5C/ /GANTm5C)последовательностей различаются. Hinfl не расщепляет ДНК фага ХР12 [152., 258]. Неметилнрованную последовательность GANTC Hinfl расщепляет эффективнее, чем гемиметилированиую GAN rm5C/GANTC, а последнюю эффективнее, чем GANTm5C/GANTm5C. Однако, разница в скорости расщепления неметилированных н полностью метилированных Hinfl участков не превышает 10 раз [182, 258, 2187]. Hpall расщепляет неметилнрованную цепь в гемиметилированной последовательности m5CCGG/CCGG. Скорости расщепления приведены в ссылке [106]. КрШ согласно ссылке [299А], чувствительна к гемиметилированию участков GGTAm5CC и GGTACm5C. Однако, Kpnl хорошо расщепляет га5С-замещенную ДНК фага ХР12 и ОТш6АС-модн-фицированиую ДНК вируса NY2A хлореллы [258 [. Вероятно, что MKpnl присуща ш4С модифицирующая способность. Maell медленно расщепляет неметилнрованную цепь в гемиметилированной последовательности Am5CGT/ /ACGT [258 [. Mbol нзошизомерами, чувствительными к Gm6ATC метилированию, являются BssGII, BsaPI, BstXII, BstEIII, Cpal, DpnII, FnuAII, FnuCI, Mmell, MnoIII, MosI, Ndell, Nfll, Nlall, Nsul, SmMI 319]. MboII расщепляет полностью ш5С-замещенную ДНК фага ХР12 [|258], однако отмечено [162], что некоторые ш5С-содержащие гемнметилированные субстраты ие расщепляются этой рестриктазои. Mfll медленно расщепляет участки mSAGArCY [284]. Mspl расщепляет как неметилнрованную, так и метилированную цепи в дуплексах Cm5CGG/OCGG [169, 384] и Cm4CGG/CCGG [106]. GGCm5GGG Mspl расщепляет очень медленно [99, 202]. Клонированная MMspI метилирует крайний цитозин (m5CCGG) [383, 384]. Однако, отмечено что хромосомная Moraxella sp. ДНК модифицирована в участках m5Cm5CGG [195]. Mvalj расщепляет неметнлированную цепь в гемиметилированной последовательности Cm4CWGG/CCWGG [258]. Nanll расщепляет только dam-метнлированную ДНК [258]. Nanll расщепляет MEcodam модифицированную ДНК фага ХР12 [258] Neil расщепляет m5Cm5CCGG метилированную ДНК [98, 195]. Вероятно,.

56

второе метилирование элиминирует Cm5CGG эффект. Ncol блокируется MSecI (CCNG) [258]. Ncrl, выделяемая из Nocardia carnia Beijing, является изошизомером Bglll [268]. Ndel расщепляет полностью ш5С-замещенную ДНК фага ХР12 [258]. Ndell расщепляет полностью ш5С-замещеииую ДНК фага ХР12 [258]. NmuDI расщепляет только dam метилированную ДН'К [258]. NmuEI расщепляет только dam метилированную ДНК [258]. Rsal расщепляет полиостью ш5С-замещенную ДНК- фага ХР12 [258], но не расщепляет ДНК вируса NY2A хлореллы, модифицированную в участках GTm6AC [258, 404], ДНК, выделенная из Rhodopseudomonas sphaeroides species Kaplan, расщепляется Asp718I, но не Rsal илн Kpnl [258]. Так как Asp718I и Kpnl расщепляет ДНК NY2A (GTm6AC), специфичность MRsal скорее всего GTAm4C. В ДНК R. sphaeroides содержится высокий уровень ш4С [130]. RsrI не расщепляет гемнметнлнрованную последовательность Gm6AATTC/G ААТТС. Sau3AI расщепляет неметилированную цепь в гемнме-тилированной последовательности GATm5C/GATC [70, 358]. Sau3AI расщепляет m6AGATC с пониженной скоростью [284]. Изошизомерами Sau3AI, нечувствительными к метилированию Gm6ATC, являются Bce243I, Bsp671. BspAI, BspPH, BsrPII, Cpel, FnuEI, MthI, iNsiAI, Pfal [319]. Sfil не расщепляет MBgll модифицированную ДНК [378]. Sfil расщепляет M НаеЩ модифицированную (GGm5CC) ДНК вируса Ad2 или фага Я, но не расщепляет полностью ш5С-модифицированнук> ДНК фага ХР12 [258]. Smal расщепляет неметилированную цепь в гемиметилнроваиной последовательности CCm5CGGG/CCCGGG [106, 384]. Smal может расщеплять Cm5Cm5CGGG метилированную ДНК [98, 195]. Вероятно, второе метилирование элиминирует эффект CCm5CGGG. В отношении Smal, имеются противоречивые результаты: метилирование m5CCCGGG, осуществляемое MAquI [200] или МНаеШ в перекрывающихся МНаеШ—Smal участках (GGm5CCCGGG) [258] блокирует расщепление рестрнктазой Smal. Другими исследователями сообщается, что Smal ограниченно расщепляет гемнметнлнрованную последовательность m5CCCGGG [106]. SplI расщепляет GTm6AC-модифицированную ДНК вируса NY2A хлореллы [258]. TaqI очень медленно расщепляет Thm5CGA [182]. TaqI расщепляет полностью ш5С-замещенную ДНК фага ХР12 [258]. Xbal расщепляет гемиметилированную последовательность Tm5CrAGA/TCTAGA при использовании высоких избытков фермента (>100 ед Xbal/мкг ДНК), но не расщепляет этой последовательности при использовании 20—40-кратных функциональных избытков. XhoII медленно расщепля

страница 18
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73

Скачать книгу "Ферменты рестрикции и их применение" (1.59Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(14.11.2019)