|
|
Ферменты рестрикции и их применениеCCAN6TGG ? m5CCAN6TGG CCmeAN6TGG BsuEI CGCG ? m5CGCG* BsuFI CCGG ? m5CCGG* BsuMI CTCGAG ? CTm5CGAG* BsuQI CCGG ? "¦CCGG BsuRI GGCC ? GG»5CC*e BsuRlI CTCGAG CTmCGAG* Cfol GCGC ? Gm5CGC Ghm5CGhm5C Cfrl YGGCCR ? YGGm5CCR* Cfr6I CAGCTG ? CAGm4CTG* CAGm5CTG Cfr9I CCCGGG6 Cm5CCGGG m4CCCGGG CCm5CGGG m5CCCGGG Cm4CCGGG* CCm4CGGG CfrlOI RCCGGY ? Rm5CCGGY+ Cfrl 31 GGNCC ? GGNm5CC* Clal ATCGAT ? m«ATCGAT ATm5CGAT ATCGm6AT* Cpel TGATCA ? TGm6ArCA Cspl CGGWCCG ? CGGWm5CCG m5CGGWCm5CG Csp45I TTCGAA ? TTCGm6AA 51 Продолжение таблицы 12 Рестриктаза Узнаваемая последовательность Расщепляемые последовательности Нерасщепляемые последовательности CviAl GATC ? Gm6ATC CviBI GANTC ? Gm6ANTC* CViJI RGCY ? RGm5CY* CviNYI CC Cm5C Ш5СС# CviQI GTAC GTAm5C GTm6AC* Ddel CTNAG ? m5CTNAG* hm5CTNAG Dpn I Gm6ATC6 Gm6ATC GATC От6ДТш5Сб GAT^C Gm6ATm4C GATm5C DpnII GATC ? Gm6ATC* Dra II RGGNCCY ? RGGNCm5GY Eael YGGCCR ? YGGm5CCR* YGGCm5CR EagI CGGCCG ? CGGm5CCG GAAGAG m5CGGCm5CG Earl ? GAAGm6AG Eco47I GGWCC ? GGWC^C Eco47III AGCGCT ? AGm5CGCT EcoRI GAATTC GAATPm5C Gm6AATTC6 GAm6ATTC* GAArTm5C EooRIl CCWGG6 m5CCWGG ™4CCWGG Cm4CWGG Cm5CWGG* CCm6AGG hn5Chm5CWGG EcoRV GATATC GATATm5C6 Gm6ATATC* Espl GCTNAGC GC rNAGm5C Gm5CTNAGC Fnu4HI GCNGC ? Gm5CNGC GCNGm5G FnuDII CGCG ? m5CGCG CGm5CG FnuEI GATC Gm6ATC6 э Fokl CATCC CATm5CC GGm6ATG САТСш5С6 Cm6ATCC Fspl TGCGCA ? TGm5CGCA Haell RGCGCY6 ? RGm5CGCY RGhm5CGhm5CY Haelll GGCC GGCm5C GGm5CC*6 QQhm5Chm5C Hap 11 CCGG ? Cm5CGG* Hgal GACGC ? GACGn5C HgiAI GRGCYC ? GRGm5CYC HgiJII GGYRCC ? GGYRCm5C Hhal GCGC ? Gm5CGC+ GCG^C Ghm5CGhm5C Hhal I GANTC ? Gm6ANTC* Hindi GTYRAC GTYRAm5C GTYRm6AC Hindll GTYRAC ? GTYRAhm5C Hinfl GANTC GANTm5C6 GTYRm6AC* Gm6ANTC 52 GANThm5C Продолжение таблицы 12 Рестриктаза Узнаваемая последовательность Расщепляемые последовательности Нерасщепляемые последовательности Hindlll AAGCTT ? m6AAGCTT+ AAGm5CTT AAGhm5CTT HinPI GCGC ? Gm5CGC Hpal GTTAAC GTTAAm5C GTTAm6AC* GTTAAhm5G Hpall CCGG ? »4CCGG ra5CCGG6 Cm4CGG6 Cm5CGG* hm5Chm5CGG HphI TCACC ? Tm5CACC* GGTGm6A Kpnl GGTACC6 GGTmSACC ? GGTAm5CC GGTACm5C GGTAm5Cm5C6 Maell ACGT6 ? An5CGT6 Mbol GATC6 gat^c Gm6Arc* GATm5C6 GAThm5C MboII GAAGA Tm5CTTm5C6 GAAGm6A* Mfll RGATCY6 ? RGm6ATCY RGATm4CY RGATm5CY Mlul ACGCGT »6ACGCGT A5mCGCGT Mmell GATC ? Gm6ATC Mnll CCTC6 ? m5CCTG rasCm5CTm5C MphI CCWGG6 ? Cm5CWGG Mrol TCCGGA TCCGGm6A ? Mspl CCGG6 ™4CCGG m5CCGG* Cm4CGG hm5Ghm5CQQ Cm5CGG Mstll CCTNAGG ™5CCTNAGG ? Mval CCWGG Cm5CWGG6 Cm4CWGC* ™5CCWGG CCm6AGG ""CCWGG6 Nael GCCGGC6 ? gm5CCGGC GCm5CGGC GCCGGmSC Nanll Gm6ATC6 Gm6ATC GATC сш6атт5сб GATm5C Narl GGCGCC GGCGCm5C GGm5CGCC Neil CCSGG ™5CCSGG Cn4CSGG Cm5csgge Ncol CCATGG ? m4CCATGG6 Ncrl AGATCT AGm6ATCTe ? Ncul GAAGA GAAGm6A ? Ndel CATATG m5CATATG6 meA Ndel I GATC GATm5C6 Gm6ATC Ngol RGCGCY ? RGm5CGCY NgoII GGCC > gg^CC* NgoBI TCACC ? тш5сасс 53 Продолжение таблицы 12 Рестриктаза Узнаваемая последов ательность Расщепляемые последовательности Нерасщепляемые последовательности GCTAGC Ош6АТСб Gm6ATC6 GCGGCCGC TCGCGA ATGCAT GATC CTCGAG CTGCAG CGATCG6 CAGCTG GTAC6 CGATCG TCATGA GAATTC CGGWCCG GAGCTC CCGCGG GTCGAC TCGCGA GATC6 GGNCC TCGCGA CCNGG GATGC GGCCN5GGCC CTGCAG GGWCC CCCGGG ACTAGT GCATGC CGTACG TCGCGA CCNGG GAATTC Gm»ArC Gm6ATC GCGGCCGm5C ? ? Gm6ATC6 ? ? CGmSATC ? qTAm5C6 CGm6ATCG ? ¦> Gm6AGCTC ? ? TCGCGm6A Gm6ATC TCGCGm6A m5CCNGG GATGm5G GCm5CCN5GGm5CC6 ? ? CmSCCGGG GCATGm5C Ghm5CATGhm5C CGrmeACG TCGCGm6A GCTAGm5C GATC GATC GCGGm5CCGC GCGGCm5CGC TCGCGm6A ATGCm6AT ? GTCGmSAG+ m5CTGCAG С TGC m6 AG* CGATm4CG CGATm5CG CAGm4CTG* CAGm5CTG GTm6AC ? TCATGm8A Gm6AATTC GAm6ATTC*6 CGGWm5CCG raSCGGWCm5CG GAGm5CTC m5CCGCGG GTm5CGAC GTCGm6AC* ? GAT'm5CGATm4C GArhn5C GGNm5CC GGNC^C GGNhm5Chm5C ? O^CNGG Gm6ATGC GGCCN5GGCm*C CTGCm6AG GGWm5CC m4CCCGGG m5CCCGGG6 Cm4CCGGG6 CCm Cm5CNGG m5CCNGG Gm6AATTC* 54 Продолжение таблицы 12 Рестриктаза
Узнаваемая последовательность
Расщепляемые последовательности
Нерасщепляемые последовательности SstI
GAGCTC
?
AGGm5CCT
?
AGGCm5CT6 StuI
AGGCCT
Tm5CGA6
TCGm6A*
Thm5CGA6
GAGhm5CThm5C TaqI
TCG A
Taqll
GACCGA
?
GmeACCGA CACCCA
TaqXI
CCWGG
m5CCWGG
?
Cra5CWGG
Till
TCGA
?
TCGmeA Thai
CGCG
?
m5CGCG
hm5CQhm5CQ TthHBI
TCGA
Tm5CGA
TCGm6A* Xbal
TCTAGA
?
TCTAGm6A*
Tm5CTAGA
Thm5CTAGA Xhol
CTCGAG6
?
CTCGAG
CTCGmeAG
¦^CTCGAG XhoII
RGATCY
RG^ATCY
RGATm5CY6 Xma I
CCCGGG
CCm5CGGG6
m4CCCGGG
m5CCCGGG
Cm4CCGGG
CC^CGGG Xmalll
CGGCCG
?
CGGn5CCG Xmnl
GAAN4TTC
GA-eAN4TrC
Gm8AAN4TTC
GAAN4Trm5C6 Xorll
CGATCG
CGm6ATCG
CGATm5CG
hm5CGAThraSCG Примечания: a. # — метилирование, осуществляемое штаммо-специфической метилазой (каноническое метилирование). М=А или С; K=G или Т; N=A, С, G, или Т; R=A или G; Y = C или Т; W=A или Т; S=G или С; D=A, G, или Т; Н=А, С или Т. Последовательности приведены в 5'-»-3' направлении. т*С= = Ы4-метилцитозин; ш5С = С5-метилцитозин; Нт5С=гидроксиметилцитозии; п,6А=К6-.метиладенин; шС=неопределена природа метилированного цитозина. Номенклатура ферментов согласно [115, 353]. б). AccI медленно расщепляет неметилированную цепь в гемиметилироваи-ной последовательности GTMKAm5C. Aha II (GRCGYC) последовательность GRCGCC расщепляет эффективнее при наличии метилирования: GRCGm5CC [258], ио не расщепляет последовательности GRCGYm5C [258, 274]. Asp718I расщепляет ДНК вируса NY2A хлореллы, модифицированную метилазой CviQI (GTm6AC). Asp718I не расщепляет последовательностей, перекрывающихся с участком, узнаваемым dcm метилазой GGTACm5CWGG [268], а также т5С-замещеиную |
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 |
Скачать книгу "Ферменты рестрикции и их применение" (1.59Mb) |
[каталог] [статьи] [доска объявлений] [обратная связь] |