Биологический каталог




Ферменты рестрикции и их применение

Автор А.А.Янулайтис

CCAN6TGG ? m5CCAN6TGG

CCmeAN6TGG

BsuEI CGCG ? m5CGCG*

BsuFI CCGG ? m5CCGG*

BsuMI CTCGAG ? CTm5CGAG*

BsuQI CCGG ? "¦CCGG

BsuRI GGCC ? GG»5CC*e

BsuRlI CTCGAG CTmCGAG*

Cfol GCGC ? Gm5CGC

Ghm5CGhm5C

Cfrl YGGCCR ? YGGm5CCR*

Cfr6I CAGCTG ? CAGm4CTG*

CAGm5CTG

Cfr9I CCCGGG6 Cm5CCGGG m4CCCGGG

CCm5CGGG m5CCCGGG

Cm4CCGGG*

CCm4CGGG

CfrlOI RCCGGY ? Rm5CCGGY+

Cfrl 31 GGNCC ? GGNm5CC*

Clal ATCGAT ? m«ATCGAT

ATm5CGAT

ATCGm6AT*

Cpel TGATCA ? TGm6ArCA

Cspl CGGWCCG ? CGGWm5CCG

m5CGGWCm5CG

Csp45I TTCGAA ? TTCGm6AA

51

Продолжение таблицы 12

Рестриктаза Узнаваемая последовательность Расщепляемые последовательности Нерасщепляемые последовательности

CviAl GATC ? Gm6ATC

CviBI GANTC ? Gm6ANTC*

CViJI RGCY ? RGm5CY*

CviNYI CC Cm5C Ш5СС#

CviQI GTAC GTAm5C GTm6AC*

Ddel CTNAG ? m5CTNAG*

hm5CTNAG

Dpn I Gm6ATC6 Gm6ATC GATC

От6ДТш5Сб GAT^C

Gm6ATm4C GATm5C

DpnII GATC ? Gm6ATC*

Dra II RGGNCCY ? RGGNCm5GY

Eael YGGCCR ? YGGm5CCR*

YGGCm5CR

EagI CGGCCG ? CGGm5CCG

GAAGAG m5CGGCm5CG

Earl ? GAAGm6AG

Eco47I GGWCC ? GGWC^C

Eco47III AGCGCT ? AGm5CGCT

EcoRI GAATTC GAATPm5C Gm6AATTC6

GAm6ATTC*

GAArTm5C

EooRIl CCWGG6 m5CCWGG ™4CCWGG

Cm4CWGG

Cm5CWGG*

CCm6AGG

hn5Chm5CWGG

EcoRV GATATC GATATm5C6 Gm6ATATC*

Espl GCTNAGC GC rNAGm5C Gm5CTNAGC

Fnu4HI GCNGC ? Gm5CNGC

GCNGm5G

FnuDII CGCG ? m5CGCG

CGm5CG

FnuEI GATC Gm6ATC6 э

Fokl CATCC CATm5CC GGm6ATG

САТСш5С6 Cm6ATCC

Fspl TGCGCA ? TGm5CGCA

Haell RGCGCY6 ? RGm5CGCY

RGhm5CGhm5CY

Haelll GGCC GGCm5C GGm5CC*6

QQhm5Chm5C

Hap 11 CCGG ? Cm5CGG*

Hgal GACGC ? GACGn5C

HgiAI GRGCYC ? GRGm5CYC

HgiJII GGYRCC ? GGYRCm5C

Hhal GCGC ? Gm5CGC+

GCG^C

Ghm5CGhm5C

Hhal I GANTC ? Gm6ANTC*

Hindi GTYRAC GTYRAm5C GTYRm6AC

Hindll GTYRAC ? GTYRAhm5C

Hinfl GANTC GANTm5C6 GTYRm6AC*

Gm6ANTC

52 GANThm5C

Продолжение таблицы 12

Рестриктаза Узнаваемая последовательность Расщепляемые последовательности Нерасщепляемые последовательности

Hindlll AAGCTT ? m6AAGCTT+

AAGm5CTT

AAGhm5CTT

HinPI GCGC ? Gm5CGC

Hpal GTTAAC GTTAAm5C GTTAm6AC*

GTTAAhm5G

Hpall CCGG ? »4CCGG

ra5CCGG6

Cm4CGG6

Cm5CGG*

hm5Chm5CGG

HphI TCACC ? Tm5CACC*

GGTGm6A

Kpnl GGTACC6 GGTmSACC ?

GGTAm5CC

GGTACm5C

GGTAm5Cm5C6

Maell ACGT6 ? An5CGT6

Mbol GATC6 gat^c Gm6Arc*

GATm5C6 GAThm5C

MboII GAAGA Tm5CTTm5C6 GAAGm6A*

Mfll RGATCY6 ? RGm6ATCY

RGATm4CY

RGATm5CY

Mlul ACGCGT »6ACGCGT A5mCGCGT

Mmell GATC ? Gm6ATC

Mnll CCTC6 ? m5CCTG

rasCm5CTm5C

MphI CCWGG6 ? Cm5CWGG

Mrol TCCGGA TCCGGm6A ?

Mspl CCGG6 ™4CCGG m5CCGG*

Cm4CGG hm5Ghm5CQQ

Cm5CGG

Mstll CCTNAGG ™5CCTNAGG ?

Mval CCWGG Cm5CWGG6 Cm4CWGC*

™5CCWGG CCm6AGG

""CCWGG6

Nael GCCGGC6 ? gm5CCGGC

GCm5CGGC

GCCGGmSC

Nanll Gm6ATC6 Gm6ATC GATC

сш6атт5сб GATm5C

Narl GGCGCC GGCGCm5C GGm5CGCC

Neil CCSGG ™5CCSGG Cn4CSGG

Cm5csgge

Ncol CCATGG ? m4CCATGG6

Ncrl AGATCT AGm6ATCTe ?

Ncul GAAGA GAAGm6A ?

Ndel CATATG m5CATATG6 meA

Ndel I GATC GATm5C6 Gm6ATC

Ngol RGCGCY ? RGm5CGCY

NgoII GGCC > gg^CC*

NgoBI TCACC ? тш5сасс

53

Продолжение таблицы 12

Рестриктаза

Узнаваемая последов ательность

Расщепляемые последовательности

Нерасщепляемые последовательности

GCTAGC Ош6АТСб Gm6ATC6 GCGGCCGC

TCGCGA ATGCAT

GATC CTCGAG CTGCAG

CGATCG6

CAGCTG

GTAC6 CGATCG TCATGA GAATTC

CGGWCCG

GAGCTC CCGCGG GTCGAC

TCGCGA GATC6

GGNCC

TCGCGA CCNGG GATGC GGCCN5GGCC CTGCAG GGWCC CCCGGG

ACTAGT GCATGC

CGTACG TCGCGA CCNGG

GAATTC

Gm»ArC Gm6ATC GCGGCCGm5C

? ?

Gm6ATC6 ? ?

CGmSATC ?

qTAm5C6

CGm6ATCG ? ¦>

Gm6AGCTC ?

?

TCGCGm6A Gm6ATC

TCGCGm6A m5CCNGG GATGm5G GCm5CCN5GGm5CC6 ?

?

CmSCCGGG

GCATGm5C Ghm5CATGhm5C CGrmeACG TCGCGm6A

GCTAGm5C GATC GATC GCGGm5CCGC GCGGCm5CGC TCGCGm6A ATGCm6AT ?

GTCGmSAG+ m5CTGCAG С TGC m6 AG* CGATm4CG CGATm5CG CAGm4CTG* CAGm5CTG GTm6AC ?

TCATGm8A Gm6AATTC

GAm6ATTC*6

CGGWm5CCG raSCGGWCm5CG

GAGm5CTC

m5CCGCGG

GTm5CGAC

GTCGm6AC* ?

GAT'm5CGATm4C GArhn5C GGNm5CC GGNC^C GGNhm5Chm5C ?

O^CNGG Gm6ATGC GGCCN5GGCm*C CTGCm6AG GGWm5CC m4CCCGGG m5CCCGGG6 Cm4CCGGG6 CCm? ?

Cm5CNGG m5CCNGG Gm6AATTC*

54

Продолжение таблицы 12

Рестриктаза Узнаваемая последовательность Расщепляемые последовательности Нерасщепляемые последовательности

SstI GAGCTC ? AGGm5CCT

? AGGCm5CT6

StuI AGGCCT Tm5CGA6 TCGm6A*

Thm5CGA6 GAGhm5CThm5C

TaqI TCG A

Taqll GACCGA ? GmeACCGA

CACCCA

TaqXI CCWGG m5CCWGG ?

Cra5CWGG

Till TCGA ? TCGmeA

Thai CGCG ? m5CGCG

hm5CQhm5CQ

TthHBI TCGA Tm5CGA TCGm6A*

Xbal TCTAGA ? TCTAGm6A*

Tm5CTAGA

Thm5CTAGA

Xhol CTCGAG6 ? CTCGAG

CTCGmeAG

¦^CTCGAG

XhoII RGATCY RG^ATCY RGATm5CY6

Xma I CCCGGG CCm5CGGG6 m4CCCGGG

m5CCCGGG

Cm4CCGGG

CC^CGGG

Xmalll CGGCCG ? CGGn5CCG

Xmnl GAAN4TTC GA-eAN4TrC Gm8AAN4TTC

GAAN4Trm5C6

Xorll CGATCG CGm6ATCG CGATm5CG

hm5CGAThraSCG

Примечания:

a. # — метилирование, осуществляемое штаммо-специфической метилазой (каноническое метилирование). М=А или С; K=G или Т; N=A, С, G, или Т; R=A или G; Y = C или Т; W=A или Т; S=G или С; D=A, G, или Т; Н=А, С или Т. Последовательности приведены в 5'-»-3' направлении. т*С= = Ы4-метилцитозин; ш5С = С5-метилцитозин; Нт5С=гидроксиметилцитозии; п,6А=К6-.метиладенин; шС=неопределена природа метилированного цитозина. Номенклатура ферментов согласно [115, 353].

б). AccI медленно расщепляет неметилированную цепь в гемиметилироваи-ной последовательности GTMKAm5C. Aha II (GRCGYC) последовательность GRCGCC расщепляет эффективнее при наличии метилирования: GRCGm5CC [258], ио не расщепляет последовательности GRCGYm5C [258, 274]. Asp718I расщепляет ДНК вируса NY2A хлореллы, модифицированную метилазой CviQI (GTm6AC). Asp718I не расщепляет последовательностей, перекрывающихся с участком, узнаваемым dcm метилазой GGTACm5CWGG [268], а также т5С-замещеиную

страница 17
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73

Скачать книгу "Ферменты рестрикции и их применение" (1.59Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(20.09.2019)