|
|
Основы биохимии. Том 1ют в реакции, в которых принимают участие функциональные группы их боковых цепей. Например, цистеин вступает в реакции, характерные для сульфгидрильной группы (—SH), тирозин — в реакции феноль-ной группы и т. д. Такие же реакции характерны для белков, содержащих соответствующие R-группы. 4.2.5.1. Реакция с нингидрином Аминокислоты взаимодействуют с нингидрином (гидратом трикетогидрин-дена) с образованием С02, аммиака и альдегида, содержащего на один атом углерода меньше, чем соответствующая аминокислота. В результате реакции возникает голубое или фиолетовое окрашивание, что позволяет осуществить колориметрическое количественное определение аминокислот. Однако эта цветная реакция ие является специфической для аминокислот, поскольку окрашенный продукт с нингидрином дает и ??3, и многие другие соединения, содержащие аминогруппу (в том числе пептиды и белки), с тем лишь отличием, что при этом ие выделяется С02. Поэтому образование С02 при реакции с нингидрином —¦ характерный признак присутствия свободной карбоксильной группы, расположенной рядом с аминогруппой, т. е. специфично для а-аминокарбоно-вых кислот. Пролин и оксипролии при реакции с нингидрином образуют производное, окрашенное в желтый цвет. Реакция нингидрина с ?-аминокислотой протекает следующим образом: Л—С—СООН + ? ? ??-аминокислогла «ингидрин [трикетогиндринденгилрат) 4. БЕЛКИ. I 119 + С02 + R—С=0 ? ОН дииетогидриндилидендикетпогидрин-дамип альдегид 4.2.5.2. Специфические реакции аминокислот Цветные реакции отдельных аминокислот широко используются для аналитических целей. В такие реакции вступает также большинство белков, что помогает при их количественном определении нли идентификации. Некоторые из перечисленных ниже реагентов используются для опрыскивания бумажных хро-матограмм с целью обнаружения отдельных аминокислот или пептидов, содержащих эти аминокислоты (разд. 5.6.3.2). Реакция Сакагучи. Гуаничины при взаимодействии с ?-нафтолом и гнпохло-рндом натрия в щелочной среде дают красное окрашивание; эта реакция применяется для обнаружения аргинина. Реакция с альдегидами. Производные индола при взаимодействии со многими ароматическими альдегидами образуют интенсивно окрашенные продукты. л-Диметиламннобензальдегнд в H2SO4 при реакции с триптофаном дает красно-фиолетовое окрашивание (реакция Эрлиха). Эта реакция может быть использована для количественного определения триптофана в белках. Реакция Паули на гистидин и тирозин. Гистидии и тирозин в щелочных растворах реагируют с диазотированной сульфаннловой кислотой, образуя производные, окрашенные в красный цвет. Биуретовая реакция. ?-Амннокнслоты в пептидах дают бнуретовую реакцию, которая используется для качественного и количественного определения белка в растворе с помощью спектрофотометрнческнх методов. Бнурет образуется при нагревании мочевины до ~180°С. В присутствии сильной щелочи биурет дает с раствором CUSO4 фиолетовое окрашивание. В бнуретовую реакцию вступают пептиды, содержащие по крайней мере две пептидные связи, т. е. трнпептиды и т. д. Дипептнды и аминокислоты (кроме гистнднна, серина и треонина) не вступают в эту реакцию. Реагент Эллмана. Существует много методов обнаружения тиоловых групп цистеина в пептидах и белках. Один из них — реакция с 5,5'-днтнобнс(2-ннт-робензойной кислотой), в результате которой происходит образование тионнтро-бензойной кислоты, обладающей в слабощелочной среде (рН 8) сильным погло- О II 2?2?—С—??2 мочевина нагревание 120 I. ОСНОВНЫЕ КОМПОНЕНТЫ КЛЕТКИ щеннем при 412 нм. Поэтому количество образующегося в результате реакции продукта может быть опретелено спектрофотометричсскн. N02 N02 NH2 + HS-CH2—CH—COOH 5,5-дигпиобис (2-нитрооенэойная кислота) NO, СООН NO, СООН NH, I —S-CH2-CH-COOH SH тионитпробензойи-т кислота 4.2.6. Номенклатура Согласно номенклатуре пептидов, аминокислотные остатки перечисляются в порядке их расположения в цепи, начиная со свободной «-аминогруппы, которую при изображении структуры пептида обычно располагают слева. Название каждого остатка получаст окончание -ил, за исключением концево.о остатка, несущего незамещенную карбоксильную группу. Тетрапептид алапилглицилтиро-зилглутамнповая кислота имеет следующую структуру: NH, О СН,—СН—С—NH—СН, -NH—СН-С—NH—СН—СООН I I сн, сн, I 2 СООН ОН аланилглицилтпирозилглутаминовая кислота Названия аминокислотных остатков образуются, как уже было упомянуто, путем добавления окончания -ил. Таким образом, названия глнцил, аланнл, серил н т. д. используются соответственно для остатков глицина, аланина, серина. Не следует путать глутамнл и глутаминил, а также аспартил и аспара-гиннл. При написании последовательностей длинных пептидов вместо полного названия удобно использовать трех- или однобуквенные обозначения. В табл. 4.1 4. БЕЛКИ. I 121 приведены общепринятые обозначения, используя которые вышеупомянутый тетрапептид можно записать следующим образом: H.2N—Ala—Gly—Туг—Glu—СООН или ?GYE Такие сокращения применяются только для обозначения остатков в последовательности, но не для свободных аминокислот. 4.2.7. Синтез пептидов Органический синтез сложных пептидов сопряжен с определенными методическими трудностями. Прежде всего для того, чтобы соединить аминокислоты специфической пептидной связью, следует «защитить» те их амино- и карбоксильные группы, которые не должны участвовать в ее образовании, и таким образом снизить их реакционную способность. Кроме того, нужно блокировать все реакционноспособные боковые цепи аминокислот или проводить реакцию с образованием связи между аминокислотами таким способом, при котором эти группы не затрагиваются. Некоторые из защитных групп, используемых в пептидном синтезе, приведены в табл. 4.3. Далее конденсация должна проводиться таким образом, чтобы не происходило рацемизации или химического изменения боковых цепей. Большинство реакций образования пептидной связи включают активацию ?-карбоксильных групп, обычно путем получения определенных типов смешанных ангидридов кислот или реакционноспособных сложных эфиров; Таблица 4.3 Некоторые защитные группы, используемые в пептидном синтезе Защитная группа Блокируемая группа Метод удаления защитной группы Карбобензоксигруппа (Cbz) Трифенилметильная (три-тильная) трег-Бутоксикарбонильная 'Фтал ильная Трифторацетильиая Бензильная ?-Толуолсульфонильиая (тозильиая) Этокси- или метоксиэфир-ная Бензоксиэфирная грег-Бутоксиэфирная Ацетильная Аминогруппа Сульфгидрильная Аминогруппа Карбоксильная » Гидроксидная Н2/палладиевая чернь; в уксусной кислоте H2/Pd НВг Трифторуксусная кислота Гидразин Слабая щелочь Металлический натрий в жидком аммиаке То же Слабая щелочь Слабая щелочь; H2/Pd Трифторуксусная кислота; НВг в уксусной кислоте Слабая щелочь 122 I. ОСНОВНЫЕ КОМПОНЕНТЫ КЛЕТКИ Таблица 4.4 Некоторые конденсирующие реагенты, применяемые в пептидном синтезе Конденсирующий реагент Структура Смешанный ангидрид Дициклогексилкар-бодиимид (ДЦКД) Изобутилхлорфор-миат ?,?'-Карбонилдиими-дазол п-Нитрофениловый эфир3 / \_N—Г—N1—/ \ о il с4Н9-0—с—С1 ? о n II /= ;n-c—n. о ??— r—с—о—с 11 /—Ч о о il II r-c-0—с—о—qh, II r—с—n о r—с—о— . //-no, Получают при взаимодействии аминокислоты и л-иитрофенола в присутствии ДЦКД. некоторые из них приведены в табл. 4.4. И наконец, защитные группы должны удаляться количественно в мягких условиях, в которых не происходит перегруппировок, рацемизации или разрывов образованных пептидных связей. Если группы, блокирующие NH2— и —соон, обозначить соответственно ? и Z, а соединение, образующее смешанный ангидрид, — X, то синтез дипептида можно представить в виде следующей серии реакций: НЯ-СНк'-СООН YHN—CHR1—СООН HjN—CHR2 —СООН YHN—CHR1 —СОХ + H2N—CHR2—COOZ J YHN—CHR1 — CO—NH—CHR2—COOZ снятие эящит-у/ N. снятие только ных групп yf защитной ? и ? у/ Х^группы ? H2N—CHR1 — CO—NH—CHR2—COOH H2N—CHR1 — CO—NH—CHR2 —COOZ 4. БЕЛКИ. I 123 Существует много способов синтеза более длинных пептидов. Например, можно провести конденсацию пептида (у которого защитная группа ? снята, a ? блокирует СООН) с YiNH—CHR3—СОХ. Другим способом синтеза может служить реакция активированного пептида с ?-защищеиной аминогруппой и пептида с ?-защищенной карбоксильной группой. Приведенный ниже синтез глициллейци-на иллюстрирует одни из возможных путей, который может быть использован для получения дипептида: II СН2—О—С—С1 + ?2?—сн2—СООН Cbi-Cl глицин сн3ч ™* сн—сн,—с—с ? ООН сн, СН \ I у лейцин |с^,он.н- ??, I СН—СН,—С—СООСоН, сн, ? этиловым эфир лейцина ООН Cbz-глицин + О с4н„—о—с—? изобутилхлоркарбонат о о о II II II СН2—О—С—NH—СН2—С—О—С—С4На смешанный ангидрид (промежуточное соединение) СН. ¦сн" сн, О О СН2 О If II I II СНР—О—С—NH—СН2—C-NH—С-С-ОС2Н5 + с.н,—о- н . * этиловый эфир Cbz-глициллейцина с 'эдкр 1. обработка ? стадия 2: газиоораз-рч.зсээле^гГ! щелочью для 1 ный нй,РЬ для уц?г?чио эфирной группы I удаления Cbz О II -с—он СН3ч /СН с 3 сн I сн, о ЭЧ2—С—NH—СН—С—ОН ? глициллейчин толуол /Г~ СН3 + С02 + СН3СН2ОН Синтез пептида может быть осуществлен не только в растворе, но и с помощью так называемого твердофазного метода. В соответствии с этим методом аминокислоту присоединяют карбоксильной группой (посредством сложноэфирной связи) к нерастворимому полимеру, а затем проводят реакцию с защищенной аминокислотой, в результате чего образуется пептидная связь. При этом синтезируется защищенный дипепгид, по-прежнему прикрепленный к полимеру. Защитную группу можно удалить, а весь процесс повторять до получения желаемого продукта. Затем пептид отделяют от полимера. Преимущество метода заключается в том, что на каждой стадии примеси и побочные продукты легко удаляются простым промыванием полимерного носителя подходящими растворителями. Кроме того, при использовании в реак |
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 |
Скачать книгу "Основы биохимии. Том 1" (7.28Mb) |
[каталог] [статьи] [доска объявлений] [обратная связь] |