Биологический каталог




Молекулярные основы действия ферментов

Автор С.Е.Северин, Г.А.Кочетов

х анилина показало, что в случае N (6) -алкнл(-арил) аденинов н 6-ацил-аденннов влиянием N(6) Н-группы на значение л для Rn<6> можно пренебречь. Для последней группы соединений jirn^ принималось равным я соответствующего альдегида. В случае уреидопурииов такое упрощение недопустимо,

ПОЭТОМУ было принято, ЧТО nHNHCO = JlB+JT.NHeO »Яв+ (Ядмфеммлмочевмиы—

я»нилжна — явеизолв). При расчете я для Rn<6>, имеющих разветвление в а-по-ложении, вводился инкремент на разветвление [23].

130

размеры Rn(6> близки к размерам амильного радикала (рис. 2, корреляция I). Подобная корреляция наблюдается и для соединений с разветвленными в а- или р-положениях Rn(6>, размеры которых также близки к размерам амила (см. рис. 2, корреляция II).

Соединения, имеющие большие размеры Rn(6>, не подчиняются описанным выше корреляциям независимо от гидрофобности Rn(6) (см. Табл. 2).

Гидрофобное взаимодействие — основной тип связи Rn<6) с рецептором. Низкая цитокининовая активность соединений с RN(6).

Рис. 2. Зависимость цитокинвновой активности N (6)-замещенных аденннов от

гидрофобности Rn<6). а — корреляции для цитокининов, имеющих гидрофобные Rn<6) (I, II); б — точки, соответствующие значениям активности и параметру я для веществ, содержа ¦ щих полярные группы в Вм(в> (я рассчитаны с учетом инкремента полярных заместителей) ; в — корреляции активности от параметра л для цитокининов, имеющих гидрофобные и полярные заместители в Rn<6> (прямые I, II); значения л рассчитаны без учета инкрементов полярных группировок. Условные обозначения: 1 — ациладенииы; 2 — 6-арил-, 6-арилметил-, 6-алкениладенниы; S — соединения с алициклическими Rn(6>; 4— соединения с разветвленными в а- илн р-положениях Rn<6)'. 5 — 6-алканоладеннны; 6 — 6-(пиридилметил)аденины; 7 — 6-алко-ксналкиладеннны; 8 — 6-алканоладеннны, имеющие разветвления в а- или р-по-ложенин Rn(6>; 9 — 6-алкиладеиины; 10 — 6-уреидЬпурины; //—6-алкоксиалкил-

аденины, с разветвленными Rn<6>-Для основное корреляции (I) (исключая соединения XIV—XVII, XXV):

гСх'п =2,1 lgn + 4,8 (г = 0.98).

Сх.ИПА

При включении данных для всех веществ, указанных в таблицах, уравнение принимает вид:

ГС*,П =-,l,51gJt + 4,2(r=0,87) Для основной корреляции II:

ГС"П = -2,1 lgn + 6,4 (г = 0,97)

5* 131

содержащими отрицательно заряженные группы (СОО~-группу, тетразолил [18, 25]) или положительно заряженные аммонийные группы [26, 27], говорит об отсутствии электростатического взаимодействия RN(6) с рецептором.

Образование я-комплекса между Rn(6) и рецептором также мало вероятно, поскольку аналоги 6-бензиладенина, имеющие одинаковую гидрофобность, но содержащие в бензольном ядре элек-троноакцепторные (С1) и электронодоиорные (СН3) заместители, имеют одинаковую активность (ср. LIX и LXIII в табл. 2). В пользу такого вывода говорит также тот факт, что корреляциям I и 1Г (рис. 2) подчиняются соединения с насыщенными и ненасыщенными алифатическими RN(6> (ср., например, IV, V и VII—XII в табл. 1).

Основной трудностью, с которой сталкивались некоторые авторы [19, 21], была высокая активность соединений, содержащих в RN(6) ОН—, —О—, >N (см. табл. 3). Как видно из рис. 2Б, ци--токининовая активность таких соединений выше, чем можно было бы ожидать, судя по гидрофобным свойствам их Rn(6>- Этот факт можно объяснить тем, что полярная группировка в Rn<6> не попадает в гидрофобную зону рецептора, оставаясь в полярной-зоне (2). Для проверки этого предположения расчет Р для RN(6> таких соединений был проведен без учета инкремента полярной группировки. Как видно из сравнения рис. 2Б и рис. 25, при такой поправке активность соединений LXIX—XCVI (табл. 3) удовлетворительно описывается корреляциями I и II в зависимости от того, имеет ли Rn<6) разветвления в а- или R-положениях, а также в зависимости от расположения полярной группировки в Rn(6> (ср., например, LXXVIII и LXXIX в табл. 3 и на рис. 25) 4.

Следует отметить, что полярные группировки в а-положении RN(6) (XXI—XXV, табл. 1; XXXVII—XXXIX, табл. 1), а также жестко фиксированные в районе а-пЪложения (XXVI—XXIX, табл. 1), попадают в гидрофобную зону рецептора, не «дотягиваясь» до полярной зоны. Эти соединения (XXI—XXIX, XXXVII—XXXIX, табл. 1) подчиняются корреляциям 1,и II (см. рис. 2А).

Модель гидрофобной щели. Как видно из рис. 2, значение параметра «а» в уравнении (см. подпись к рис. 2) близко к двум. Это означает, что энергия связывания Rn<6> с рецептором вдвое больше, чем соответствующее изменение свободной энергии при •переносе заместителя из полярной среды в гидрофобную фазу-Объяснение этого эффекта было дано в рамках модели гидрофобной «щели», исходно заполненной водой [1, 28, 3]. В рамках этой модели связывание Ящеу приводит к вытеснению воды из щели; свободная энергия связывания Rn(6> оказывается равной сумме свободных энергий дегидратации как самого Rn<6), так и щели рецептора. Предположение о щелеобразной структуре рецептора в об-

4 Предположение об образовании специфической связи полярной группировки в i?n(6> соединений LXIX—XCVI с рецептором кажется маловероятным: как видно из сравнения рис. 2,Б н рнс. 2,В, энергия такой связи была бы в точности равна —2,303 R Гл, где л — инкремент полярной группировки в Rnw)-

«32

\

Соединения с высокополярными группировками в Rn<6>

Таблица 3

№ л Среднее значение

R С* п сх, ИПА (тест /) Литература

6-алканоладенины LXIX 2-гидроксиэтнл неактивен [20]

LXX 3-гидрокснпропил неактивен 20]

LXXI 4-гидроксипропил 0,56 20]

LXXII 5-гидроксиалил 0,56 20]

LXXIII 6-гидрокснгексила 0,56 20]

LXXIV 4-гидрокси-ццс-Да-бутеиил 1,94 47]

LXXV 4-гидрокси-3-метнл-ццс-Да-бутенил (цис-зеа- 1,08 47]

тин)

-LXXVI 4-гидроксн-3-метил-тракс-Да-бутенил —0,36 [47,32,22,26,

(транс-эехпт) 36,33,161 LXXVII 4-гидрокси-?-амнл (дегидро-зеатин-рацемат 0,20 [36,47,33] LXXVIII R (-|-)-4-гидроксн-1-амил 0,15 - [48] - LXXIX S (-)-4-гидрокси-1-амил 1,85 [48] LXXX 3-гидрокси-?-амил 1,75 [36,32] LXXXI 3,4-днгидрокси-«'-амнл (рацемат) 1,89 [36] LXXXII 2-гидрокси-1"-амнл(-рацемат) 1,41 [36] LXXXIII 2,3-дигидрокси-1-амил (рацемат) 2,36 [361

LXXXIV 2,3,4-тригидрокси-1-амил (рацемат) 1,9 [491

6-алканоладенины с разветвленными в Р -положения Ящ^

2-метнл-4-гидроксн-и-бутил (дегидрозеатии) ,2-метнл-4-гидрокси-цш>1'-бутенил (ццс-1-зеа-тин)

2-метил-4-гндрокси-/про«с-Д2-бутенил

(mpawc-i-зеатии) S- (1 -метил-б-дезоксн-P-D- рибофу ранозид)

6-алкоксиалкаладенины

этоксиэтил

этоксиизопропил

пропоксиэтил*

бутоксиэтил2

2-тетрагидрофурфурил

6-(пиридилметил) аденина

2- пиридилметил

3- пиридилметил 4'Пиридилметил

1,53 [47] -

1,40 [47]

1,13 [471

2,20 [30]

1,56 [19]

1,91 [19]

1,56 [191

2,26 [19]

1,25 [ЗЦ .

1,18 [30,311

0,91 [31]

1,25 [31]

Примечания. I. В работе [19] эффективные концентрации цитокининов выше, ч

страница 45
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65

Скачать книгу "Молекулярные основы действия ферментов" (4.06Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(25.05.2019)