Биологический каталог




Биоорганическая химия

Автор Ю.А.Овчинников

CTG CAG ACT AGG AAC АТС CCC TTT TTT TCA ACC AAC TGC GTT GAA GGC ACT GCA CCT GGT ATT

226-250 Asn-Glu-A«n-Pro Lcu-Clu-Thr ftrg-Asn llc-Ala-Phe-Phe-Ser-Thr-ABn-Cy«-Val-Glu-Cly-Thr-Al*-Arg-Gly He-

766-840, GTG GTG TAC ACT GGC GAT CGC ACC GTG ATG GCC AGA АТС GCT ACC CTT CCT TCC GGG CTG GAA GGG GGC CAG ACT

251-275 Val 1,a 1-Ту г-Thr-Gly-Asp-Arg Thr Val-Met Gly Ar -lie Ala-Thr-Leu-Ala-Ser-Cly-Leu-Glu-Cly Cly-Cln-Thr

641-915 CCC АТС GCT GCG GAG ATT GAA CAT TTT АТС CAC АТС АТС ACG GCC GTG CCC GTG TTC CTG GGC GTG TCC TTC TTC

276-300 Pro-lle-AU-Ala-Glu-Ile-Glu-His-Phe-ne-Hli-Ile-lle-Thr-Gly-Val-Ala-Val-Phc-Leu-Cly-Val-Ser-Phe The

916-990 АТС CTT TCT CTG АТС CTC GAG TAC ACC TGG CTC GAG GCC GTC АТС TTC CTC АТС GGG АТС ATT GTA GCC AAC GTG

301-12 5 Ile-Lcu-Ser-Leu-Ilc-Lcu-Clu-Туг Thr-Trp-Leu-GIu-Ale-Val-Ile-Phe-Leu-Ile Gly-Ile-Ilc-Val-Ala-Asn-Val-

991-1065 CCT GAA GGT TTG CTG GCC ACC CTC ACG GTG TGC TTG ACC CTG ACT GCC AAG CGC ATG GCC AGG AAG AAC TGC CTT

326- 150 Prc-Clu-Gly-Leu-Lcu Ala-Thr-\ 1 Thr-Val-Су» Leu-Thr Leu Thr Ala-Lys Arg-Met-Ala Arg-Lys-Asn-Cys Lcu-

1066-1140 CTG AAG AAC TTC GAG GCT GTG GAG ACC CTG GGG TCC АСА TCC ACC АТС TGC TCA GAC AAA ACC GGA ACC CTC ACC

351- 375 V 1-Lye-Asn-Leu-Glu-AU-Vnl-Clu-Thr-Leu Gly S r-Thr Ser-Thr lie-Cys Ser-Asp-Lys Thr-CIy Thr Leu Thr-

1141-1215 CAG AAC CGA ATG АСА CTG GCC CAC ATG TCG TTC GAC AAT CAA АТС CAC GAG GCT GAC ACG ACG GAA AAT CAG AGC

376- 400 Gln-Asn-Arg-Met-Thr-Val-Ala-His-Met-Trp-Phe-ABp-ABn-Gln-lle-His-Gtu-Ala-Aap-Thr-Thr-Glu-Asn-Gln-Ser-

1216-1290 GGT GTC TCA TTC CAC AAG ACT TCG GCC ACC IGG CTT GCT CTG TCC AGA ATT GCA GGT CTT TGT AAC AGG GCA GTG

401- 425 CIу-Val-Ser Phe Asp-Lys Thr Seг-Al*-Thr-Trp-Leu->la-Lau-Ser-Arg-lle-Al«-С1y-Leu-Cy»-Asr-Arg-Alз-U]-

1291-1365 TTC CAG GCC AAC CAG GAA AAC СТА CCT АТС CTG AAG CGG GCA CTG GCG GGC GAC GCC TCC GAG TCC CCG CTC TTA

426- 450 Phe-Cln-Al*-Asn-Gln-Clu-A»n-Leu-Pro-lie-Leu-Lys-Arg-Ala-Val-Ala-Cly-Asp-Ale-Ser-Clu-Ser-Ala-Leu Leu-

1366-1440 AAC TGC АТС GAG CTG TGC TGT CGG TCC GTG AAG GAG ATG AGC GAG CGA TAC ACC AAG АТС GTC GAG ATT CCC TTC

451- 475 Lys Cys-lie Glu-Lcu-Cy»-Cys-Cly-Ser-Val-Ly»-Glu-W*t-Arg-Glu-Are-Tyг-Thr-Ly*-lle-Val-Clu-1le Pro Phe-

1441-1515 AAC TCC ACC AAC AAC TAC CAG CTG TCC АТС CAC AAG AAC CCC AAC ACG GCT GAG CCC CGG CAC CTG CTG GTC ATG

в76- 500 Asn-S r-Thr-Asn-Lys-Tyr-Cln-L«u-Ser-1le-Hia-Lys A n Pro Asn-TUr Ala-Glu-Pro-Arg Hie L u Leu-Val-Met-

кодон в мРНК расположен непосредственно перед последовательностью, кодирующей N концевую область белка.

Аминокислотные последовательности каталитических ее-субъединиц Na г, К ь-АТФаз имеют удивительно высокую степень гомологии, достигающей почти 90% даже для биологически весьма отдаленных источников (почки млекопитающих и электрический орган рыб). Стабильность структуры в ходе эволюции еще раз подчеркивает физиологическое значение «натрий-калиевого насоса» и большую роль а-субъединицы в его функционировании. Этого нельзя сказать о р1 субъединице (структуры белков из электрического органа и почек различаются уже на 38%).

АТР-Гидролизующий центр расположен в цитоплазматической области а-субъединицы. Функционально важный остаток аспара-гиновой кислоты, подвергающийся фосфорилированию при обра

625

Характеристика отдельных биологических мембранных систем

1516- 1590 АДА GGT GCT CCA GAA AGG АТС CTG GAC CGC TGC AGC TCC АТС CTC АТС CAC GGC AAG GAC CAG CCC CTA GAC GAG

501- 525 Lys -Cly Al Pro -Clu Arg -lie -Leu Asp Arg-Cyi Ser Ser He Leu He -His Cly Lys Clu Gin Pro -Leu Asp-Clu- 1591 1665 GAG CTG AAG GAC GCC TTT CAG AAC GCC TAC CTG GAG CTG GGT GGC CTC GGG GAA CGC GTG CTG CGT TTC TGC CAC

526- SS0 Glu ¦Leu Lys Asp ¦All Phe -Cln Asn Ala Tyr-Leu Clu Leu Cly Cly Leu Cly Glu Arg Val Leu Cly Phe-Cys His-

1666- 1740 CTT TTC CTG CCG GAC GAG CAG TTC CCC GAA GGC TTC CAG TTT GAC ACC GAC GAT GTG AAT TTC CCT CTC GAT AAT

SS1- S7S Leu Phe Imu Pro Asp Clu Cln Phe Pro Glu-Gly Phe Cln Phe -Asp Thr -Asp-Asp Val Asn Phe Pro Leu Asp Asn-

1741- 1815 CTC TGC TTC GTT GGG CTC АТС TCC ATG ATT GAC CCA CCG CGA GCG GCC GTC CCG GAT GCC GTQ GGC AAA TGT CGA

S76- 600 Leu-Cys Phe Val Cly Leu -lie Ser Met I le-Asp Pro Pro Are Ala Ala -Val Pto Asp Ala Val Cly Lys Cys Arg-

1816- 1890 AGC GCT GGC ATT AAG GTC АТС ATG GTC ACC GGC GAT CAT CCC АТС АСА GCC AAA GCC ATT GCC AAA GGT GTG GGC

601- 6ZS Ser -Ala Cly He Lys Val lie Met Val Thr-C1y-Asp-Hi« Pro He Thr -Ala Lys-Ala He Ala Lys Gly Val Cly-

1691- 1965 АТС АТС TCG GAA GGC AAT GAA ACG GTC GAA GAC АТС GCT GCC CGC CTC AAC АТС CCA GTG AGC CAG GTS AAC CCC

626- 650 lie -lie Ser Clu Cly Asn Clu Thr VI Glu-Asp He Ala Al в Arg Leu ¦Asn He Pro Val Ser Gin Val Asn Pro-

1966- 2040 AGG GAT GCC AAG GCC TGC GTG GTC CAT GGA AGC GAT CTG AAA GAC ATG ACC TCG GAG CAG CTG GAT GAC АТС TTG

6SI- 675 Arg-Asp-Ala Lys Ala Cys Val Val Ills Cly-Ser Asp Leu Lys-Asp -Net -Thr -Ser Glu Gin ¦Leu Asp-Asp He Leu-

204 1 - 2115 AAG TAC CAC ACG GAG АТС GTG TTT GCC CGG ACG TCT CCT CAG CAG AAG CTC АТС ATT GTG GAA GGC TGC CAG AGA

676- 700 Ly. Tyr His Thr Glu He Val Phe-Ala-Arg-Thr-Ser Pro Gin Cln -Lys -Leu -He -lie Val -Clu -Gly-Cys-Cln-Arg- CAG GGC i Cln Gly ,

GGG ATT GCT GGC -Cly-Ile-AU-Gly-

< ACG GGA GTA GAG -Thr-Gly-VJl-Glu-

TCG GAC Ser-Asp

GAA GGT

Glu-Gly

Г GGC GAC r-Gly-Asp-

GTG TCA -Val-Ser

CGT CTG -Ara-Leu-

: CTG ATA t-Leu-Ile-

GGT GTC Gly-Val

AAG CAA

¦Lys-Cln

AAT GAC TCT I Asn-Asp-Ser-I

GCT GCT GAC . Ala-Ala-Asp-I

GAT AAC TTG -Asp-Asn-Leu'

CTC TGC Leu Cys

AAG AGG Lya-Arg

GGT ATG Gly-Met

TAC GAA

Tyr-Glu-

GAC TTG Asp-Leu

АТС GAC TTG GGC ¦ IIc-Aip-Leu-Cly

CAG CCC CGA AAC

¦Cln-Pro-Arg-Ain'

АТС CAG GCC CTG -Ile-Gln-Ala-Leu

, GGC CTC CGG GTG i-Cly-Lcu-Are-Val-

CAG AGG AAG АТС ' Gln-Arg-Lys-lle-

GTC АТС TGC AAG Vnl-He-Cys-Lys

АСА GAC

Thr-Asp-I

CCC AAG

Pro-LyS'

GGC GGC Gly-Gly

AAC TGG

Asn-Trp

AAG AAA

Lya-Lys-

ATT CCA

-1 le-Pro'

; GCG TAT i i-Ala-Tyr-i

CTG AAG AAG GCA GAC -Leu-Lys-Lys-Ala-Asp'

I CTC CTG GAT GAC AAC ¦-Lcu-Leu-Asp Asp-Asn-I

TCC ATT GCC TAC ACC I Ser-Ile-Ala-Tyr-Thr-I

CTG CCC CTG GGC ACC I ¦Leu-Pro-Lcu-Cly-Thr-'

АТС GGG lle-Gly-

ACC CGG Thr-Arg

CTC AAA Leu-Lys-

CCT ЯСС TGG TGG Pro-Thr-Trp-Trp-

AGG CGA CGC CCT -An-Ar.-Arf-Pro

TTC TGT Phe-Cys

АСА GAC Thr-Asp-

TTC TTC -Phe-Phe

GAT GAC

¦Asp-Asp-

; ttc acc

i-Phe-Thr-

AGG AAT ¦Arg-Air-I

Г GCT TTC I i-Ala-Phe-l

GCC TTC ¦Ala-Phe-

AAA CTC

Lys-Leu-

ACT TAC Thr-Туг

CGC TGG Arg-Trp

TGC CAC Cys-His-

TT1 GTG АТС I Phe-Val-Ile-I

АТС AAC GAC i lle-Asn-Asp-'

CCC TAC Pro-Туг

TAC TGC CCC -Tyr-Cys-Pro-

TCG CTC CTC . Ser-Leu-Leu-

GGG ATG -Gly-Met

GGA ATG

Gly-Met

С АТС AGC ATG GCC TAC u-Ile-Ser-Met-Al -Tyr

T GAG AAC GGC TTC CTC I a-Glu-Asn-Cly-Phe-Leu-l

G GAC AGC TAC GGG CAG u-Asp-Ser-TyT-Gly-Gln'

С AGC АТС GTG GTG GTG 1-Ser-Ile-Val-Val-Val

AAG AAC AAA АТС TTG < Lys-AsYi-Lys-ne-Leu-

GGC GTG GCC CTG AGG Gly-Val-Ala-Lcu-Arg

С GTC TAT GAC GAA GTC e-Val-Tyr-Asp-Clu-Val

I ACCCCCTCCTGCACGCCG

: GAC АТС . г-Аяр-Пе-1

GGA CAG -Gly-Gln-

CAG TGG ¦Cln-Trp-

CAG TGG

•Gln-Trp-

¦ GGC

!-Cly-

ATG TAC i -Met-Туr-

AGG AAG l ¦Агя-Lys-;

626

Биологические мембраны

зова ни и интермедиата, локализован в положении 369. Другой участок а-субъединицы, предположительно входящий в активный центр фермента, включает остаток Lys-501, который модифицируется при необратимом ингибировании ферменте изотиоцианатом флуоресцеина. О принадлежности к активному центру этой области белка свидетельствует тот факт, что АТР защищает фермент от ингибирования и модификации.

Для выявления потенциальных внутримембранных участков рассчитывались профили гидросробиости полипептидных цепей субъединиц. В случае субъединицы было выявлено 11 таких участков. Из сопоставления полученных данных с аминокислотными последовательностями выделенных внемембранных пептидов предполагается, что субъединица 7 раз пересекает липидный бислой. Поскольку N концевой участок локализован в цитоплазме, то С-концевая часть экспонирована на внешней стороне мембраны (рис. 339).

Как уже упоминалось, экспонированные участки Ji-субъедииицы выявлены только на наружной стороне мембраны. Результаты

Модянов Николай Николаевич (р. 1 944) советский химик-биоорганик. Окончил Московский университет (1967), рабо-ает в Институте биоорганической химии им. М. М. Шемякина АН СССР. Занимается изучением систем активного транспорта ионов через биологические мембраны. Лауреат Государственной премии СССР (1982).

Г-1) 4-6Э

CCGCACCGGCAGGCGGT GCCAGCC TGCGGAGAGCCAGGCAGGGGACAC TGA

ТTGGCAGGAGAGGACGCAAGACGCACGCGGCААТСАСССAT С Т ТCMTCCCCGCAGCAGCTGCTGACCCGCCACC ATG

Bet

GCC CGC GGA AAA GCC AAG CAG GAG GGC AGC TGG AAG AAA TTG ATG TGG AAC TCC GAA AAG AU-Arg-G1y-Ly*-A1i-ty» i-.L-Glu-Gly-Ser-Trp-Ljs.Lyi-Phe-lle-Irp-Asn-Ser-Glii-Lys-AAG GAG TTT TTG GGC AGG ACC GGT GGC AGT TGG TTT AAG АТС CTT СТА TTC TAC GTT ATA tys-G1u-Phe-Leu-Gly-Arg-Tnr-G1y-G1y-Ser-Trp-Phe.Lys-I1e-Leu-Leu-Phe-Tyr-Vl-|le-

TTT TAT GGC TGC CTG GCT GGC АТС TTC ATT GGA ACC АТС CAA GTG ATG CTG CTC ACC АТС Phe-Tyr-Gly-Cys-Leu-»1*-Gly-Ile-P«e-Me-G1y-Thr-I1e-Gln-Ve1-Met-Leii-Leu-Thr-I1e-

АБТ GAA TTT AAG CCC АСА TAT CAG GAC CGA GTG GCC CCA CCA GGA TTA АСА CAG ATT CCT Ser-GI и-РЛе-Lys-Prc-Thr-Tyr-GIn-Aip-Arg-Vi1-Ala-Pro-Pro-Gly-Leu-Thr-Gln-11a-Pro-

CAG AGC CAA AAG ACT GAA ATT TCT TTT CGT CCT AAT GAT CCC CAA AGC TAT GAA TCC TAT Gln-Ser-Glr-Lys-Tbr-GliJ-Ile Ser-Phe-Arg-Pro-Abn-Asp-Pro-Gln-Ser-Tyr-Glu-Ser-Tyr-

GTG GTA AGC ATA GTG AGG TTC CTG GAG AAG TAC AAA GAT TTG GCG CAG AAG GAT GAT ATG Val-Val-Ser-lle.Val-Aj^-Plw-iau-Glu-Lys-Tyr-Lys-Asp-Leu-Ale-Glr-ijs-Aip-Aip-Met-

ATT TTT GAA GAT TGT GGC AAT GTG LLC AGC GAA ГТС AAA GAA CGA GGA GAA TAT AAC AAC lle-Pne Glu-AKp-Cys-Gly-Ain-Yi1-Pro-Ser-Glu-Leu-Lys-G1u-Arg~G1y-Glu-Tyr-A»)-Asr-

GAA CGA GGA GAG CGA AAA G- , TGC • G TTC AGG < 1С GAA TGG TTG GGA AAC TGC TCT GGA Glu-Arg-Gly-Glu-Arg-LyWil _y»-Arg Phf-Arg-Leu-Gtu-Trp-Leu-Gly-Asn-Cys-Ser-Gly-

TTA AAT GAT LAA ACC TAT T5C TAC AAA GAT ЛС AAA Ct TGT GTC ATT ATA AAG CTC AAC Leu-Afcn-Asp-Glu-Ttn lyr-(,ly-Tyr-l >i-Asp-Gly-Ly*-Pro-Cys-V#1-IU-Ile-Lys-Leu-Asn-

CGA GTT CTG GGC 1 AAA ci Arg-Yal-Leu-Gly-Pnp-Ly^-P'"

ATG AAG TAT AAT С » ТА

Het-Lyi-Tyr-Asn-Prc-"/*-

GAG AAA Gl GGA ACI l> I Glu-Lyt-Val ly-1 r-Hel

TAT TAC u,T TAC Tu ~ Ш. Tyr-Tyr-Prp-Tyr 'г-Ч'вЧул-

С AAG AAT GAG T (TG GAG ACT TAC CCA GTG yb-Asn-Glb-Ser-Leu-Glu-Thr-Tyr-Pro-rel-

1AT TGC ACT GGC AAG CGT GAC GAA GAT AAG I-HlS-Cys-Thr-Gly-Ly%-Arg-Asp-GIu-Asp-Lys ¦

TG GGC GCC TAC I Г GGT TTT CCT СТА CAG

BW4>vbfti-W'r-bly-Tyr-Pro- y-Phe-Pro-Leu-Gln-

GAA АН В ATA GAG TGI AAG GCG TAT GGT GAG lu-lle-Arg-rie-Glu-Cys-Lys-Ala-Tyr-Gly-blu-

AAC ATT G(~ TAC Mf г'* Ш cu ^ C»r, ГЛЙ CGC TTT GAT GTA AAA ATT GAA GTT

Asn-He-GIy-Tyr-<,c—Sin Lyi-A., U Dbe-C. |Ц) y-Arg-Bto-Atp-Val-Lyi-lle-Glu-Val-

AAG AGC TGA TCA M. -ПАААСАГ -ДАААСАТГСАСАААСАААААССГАСТАСТ

Рис. 338. Аминокислотная последовательность р-субъедииицы Naf, К -АТФазы почек свиньи.

TGAACAAAC1. TCATACGTA...» И А ТАА1 Ш'Д ,. TAC" Ю Т ТС I < ¦TTTAATAGGTTAGAAT GTAAATTTAAAGIGTAGCAAT*. ААСААААТАТТТАт'СТАСТо

модификации Na+,K +-АТФазы проникающими реагентами свидетельствуют о наличии в р-субъединице также гидрофобной внутри-мембранной области. В р-субъединице Na * ,К ь-АТФазы почек свиньи есть три углеводные цепи, присоединенные к остаткам Asp-157, Asp-192, Asp-264; следовательно, эти области белка экспонированы на внешней стороне мембраны. Сопоставляя расположение углеводных цепей с расчетом профиля гидрофобности и данными ограниченного протеолиза, можно предложить, что р-субъеднница содержит один траисмембранный участок. Эта модель служит хорошей основой для детального анализа пространственного строения и механизма функционирования Na4, К -АТФазы.

Среди других ион-транс порти рующих АТФаз наиболее хорошо изучена Са2+- АТФаза мембран саркоплазматицеского ретикулума. В 1985 г. Д. Мак-Кленоном с сотр. установлена полная первичная структура этого фермента. Он состоит из одной полипептидной цепи, содержащей 997 аминокислотных остатков, и весьма близок по структурной организации и функциональным параметрам к

627

Характеристика отдельных биологических мембранных систем

Рис. 339. Схема пространственной организации молекул а- и р-субъединнц Na +, К + -АТФазы. Предполагаемые внутри мембран ные фрагменты белка обозначены прямоугольниками. Гликози-лированные остатки аспарагина обозначены СНО.

Че*Д Л Ьм-

CVVTEKE^B^

lpolv %

0 SO

1

TOKR,

> t

Rglfekk -

1 n ¦if

* 4 \ 8 -

""и l к evnuca/ST»»>viEiw""к I JGNE,VEraWBljg|pvSQvNF',C!ERVipfCHLfL,,

1 /0П51лУ**|0 Г

628 ct-субъединице Na ', К f-АТФазы (ионы Cbz + являются в данном

случае аналогом Na1").

Биологические мембраны В клетках животных существует и другой тип CaJ +-АТФазы —

так называемая калмодулин-зависимая CaJ4-АТФаза плазматических мембран. Фермент состоит из одной полипептидной цепи (молекулярная масса — 140 ООО) и содержится в мембранах в крайне малом количестве (П. Шацман, Э. К рафоли)

Ацетилхолиновый рецептор

К рафоли (Carafoli] Эрнесто (р. 1932). швейцарский Биохимик. Образование получил в Моденском университете (Италия, 1957), с 1973 г.— профессор Высшей т хни к и школы в Цюрихе. Основные работы посвящены биоэнергетике, биохимии мембран, транспорту кальция и его метаболической роли.

Среди разнообразных мембранных белков важное место занимают рецепторные системы, ответственные за передачу информации возбудимыми клетками. Рецепторы клеточной мембраны воспринимают сигнал другой клетки и реагируют на него изменением мембранного потенциала или активацией ферментных систем. На возбудимые (нервные, мышечные или секреторные) клетки инсрормация передается через специализированное образование — синапс. Из окончания нервной клетки выделяется нейромедиатор, взаимодействующий с рецепторами постсинаптической мембраны другой клетки. Классическим примером подобных рецепторов является ацетилхолиновый рецептор (холинорецептор). Еще в 1953 г. Д. Нахманзон предположил, что этот рецептор представляет собой белок, который при взаимодействии с иейромедиатором претерпевает консрормационные изменения, ведущ

страница 83
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113

Скачать книгу "Биоорганическая химия" (11.1Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(01.05.2017)