|
|
Транскрипция и трансляция. Методы387 301 564 214 387 194 258 495 454 196 441 169 164 144 201 361 357 196 381 158 45 135 190 353 183 163 239 117 27 127 163 304 176 113 152 106 24 76 143 190 156 12 102 22 39 107 63 130 98 14 39 102 57 123 69 3 33 93 54 79 26 65 24 60 9 27 20 30 6 16 2 18 18 1 См. сноски 1 и 2 к табл. I. 1 Следующие рестриктазы ие расщепляют ДНК М13 mp7: SsiEII, HindlU, ??? ?, ??? I, Mst I, Sma I, Xho 1 или Xma I. Маркеры молекулярной массы Hhal Alul Hinfl Ddel ?coRI* МпП. 967 1446. 1288 998 1402 423 31 732 1330 771 866 665,- 421 30 725 600 571 672 567 391 28 714 555 486 652 508 384 27 .683 484 413 600 416 351 22 495 336. 348 563 406 340 21 434 331 345 399 323 318 19 340 313 328 381 283 313 18 329 220 324 376 272 304 16 312 204 274 303 247 286 1.5 29T 201 261 294 213 269 15 272 180 1 253 272 - 209 263 15 244 ' 159 •234 160 " 176 243 15 190 151 232 153 174 234 - 15 115 140 212 128 152 226 15 92 111 209 72 142 217 15 74 111 160 63 109 158 15 65 104 137 46 109 143 12 ,56 -§з 96 42 102 130 8 28. 72 80 39 99 119 6 26 . 63 63 28 96 117 5 22 39 46 27 88 .. 111 4 13 39 45 24 76 105 4- 9 27 22 15 69 102 8 26 2i 15 63 98 124 •194 15 55 90 15 53 86 15 41 76 14 40 '74 36 69 33 66 12 , 63 1 51 1 49 48 48 373 374 Приложение I Таблица 6. Размеры рестриктных фрагментов ДНК фага 0X174'·2 [7] АНаШ Narl Accl ?coRII Xmnl HpaW Hael 4307 3429 3034 2767 4126 2748 2712 1079 1957 2352 2619 974 286 1697 374 348 219 872 738 603 389 72 НаеМ Hphl Taqi Rsal Haelll Mboli Hindi 2314 1638 2914 1560 1353 1103 1057 1560 1116 1175 964 1078 1066 770 786 791 404 645 872 857 612 269 777 327 525 605 812 495 185 777 321 472 310 3% 397 125 110 141 392 281 394 392 93 77 87 247 271 324 345 54 43 54 197 232 224 341 39 33 157 194 118 335 20 138 118 89 291 89 72 3 210 162 79 Ddel FnuOU Hhal 3012 1050 1553 - 998 870 640 927 718 614 542 695 532 486 530 305 393 490 300 •303 259 269 302 176 201 186 156 192 165 127 145 38 114 143 18 103 123 10 79 101 6 19 93 84 54 35 2 1 См. сноски 1 и 2 к табл. 1. 1 Hlnf I дает 21 фрагмент, a Alu I дает 24 фрагмента. Следующие рестриктазы не расщепляют ДНК фага (4X174: Ват HI, Eco RI, Hind III, Nae I, Pvu I, Pvu II, Sal I, Sma 1, Xba I или Xho II. Таблица 7. Размеры рестриктных фрагментов ДНК фага 0X174'·2 [7] ВатШ Haell Mboll HaeUl Taql Mspl(Hpall) Alul 3425 3550 4349 2528 2019 1596 1446 2983 2033 666 1633 850 829 1330 817 384 849 703 819 705 8 332 352 652 652 554 318 311 579 648 484 1% 309 441 .501 366 163 154 381 454 314 106 357 381 257 103 287 156 220 69 139 129 204 123 201 60 166 42 111 12 29 6 27 24 1 См. сноски 1 и 2 к табл. 1. 1 Hinf I дает 24 фрагмента, a Mnl I — 51 фрагмент. Рестриктазы Bet I, Eco RI, Hind III или ??? I не расщепляют ДНК фага fd. Таблица 8. Маркеры молекулярной массы для гель-электрофореза РНК РНК . Молекуляр- Число нук- Источник ная масса1'' леотидов данных мРНК тяжелой цепи миозина кур 28S-pPHK (HeLa)4 25S-pPHK (Aspergillus)* 23S-pPHK (?. coli)* 18S-pPHK (HeLa)4 17S-pPHK (Aspergillus)4 16S-pPHK (E. coli)* мРНК кристаллина A2 из хрусталика теленка мРНК легкой цепи иммуноглобулина мыши мРНК ?-глобина мыши мРНК. ?-глобина кролика мРНК ?-глобина мыши мРНК ?-глобина кролика мРНК гистона Н4 морского ежа 5.8S-PHK (Aspergillus) 5S-PHK (?. coli) 4S-PHK (Aspergillus) 2,02 ·10« 6500 [13]S 1,90· ??6 6333 [10] 1,24·10« 4000 [19] 1,07·10е 3566 [HI 0,71·10е 2366 [10] 0,62·??6 2000 [19] 0,53·10s 1776 [12]* 0,45-??6 1460 [14] 0,39-10s 1250 [15]3 0,24-10« 783 ?6] 0,22-10« 710 [17]3 0,22-10« 696 [16] 0,20-10« 630 [17] 0,13-10« 410 [18]3 4,89·104 158 [19]» 3,72-Ю4 120 [20] 2,63-104 85 [19] 1 Молекулярные массы представляют собой приближенные величины; они вычислены, исходя из средней молекулярной массы нуклеотида, равной 310 Да. 2 При неденатурирующем гель-электрофорезе. 3 При денатурирующем гель-электрофорезе в присутствии формамида. ' Существует более обширный перечень размеров различных рРНК [21]. 376 Приложение I Таблица 9. Молекулярные массы полипептидов, используемых в качестве маркеров *·8 Полипептид Молекулярная масса, кДа Тяжелая цепь миозина из мышц кролика 212 ?'-Субъединица РНК-полимеразы Е. coli 165 ?-Субъединица РНК-полимеразы Е. coll 155 ?-Галактозидаза ?. coli 130 Фосфорилаза а из мышц кролика 92,5 Бычий сывороточный альбумин 68 Каталаза из печени быка 57,5 Пируваткиназа из мышц кролика 57,2 Глутаматдегидрогеназа из печени быка 53 Фумараза из печени свиньи 48,5 Овальбумин 43 Енолаза из мышц кролика 42 Алкогольдегидрогеназа из печени лошади 41 Альдолаза из мышц кролика 40 ?-Субъединица РНК-полимеразы Е. coli 39 Глицеральдегид-З-фосфатдегидрогеназа из мышц кролика 36 Лактатдегидрогеназа из сердца свиньи 36 Карбоангидраза 29 Химотрипсиноген А 25,7 Ингибитор трипсина из сои 20,1 Миоглобин из сердца лошади 16,95 ?-Лактальбумин из коровьего молока 14,4 Лизоцим яичного белка 14,3 Цитохром с 11,7 1 В работе, из которой взята эта таблица [22], можно найти ссылки на оригинальные работы. 2 Многие исследователи использовали в качестве маркеров молекулярной массы различные протеазы, например трипсин, химотрипсин н папаин, однако этн ферменты в определенных условиях могут вызывать протеолиз других полипептидов-маркеров и поэтому не включены в таблицу. 3 В диапазоне молекулярных масс 12—68 кДа имеется достаточное число маркерных белков, но белков большего размера, пригодных для калибровки, иеыного. В качестве таких маркеров можно использовать полипептиды, ковалентно сшитые с образованием ряда олигомеров [22]. Препараты подобных сшитых олигомеров продает ряд фирм. Литература 1. Rickwood D., Hames В. D., eds. Gel Electrophoresis of Nucleic Acids — A Practical Approach, IRL Press Ltd., Oxford and Washington, DC, 1982. 2. Sutcliffe J. G. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 43, 77 (1979). 3. Twigg A. J., Sherrat D. Nature, 283, 216 (1980). 4. Sanger F., Coulson A. R., Hong G. F., Hill D. F., Petersen G. B. J. Mol. Biol., 162, 729 (1982). 5. Fiers W., Contreras R., Haegeman G., Rogters R. Van de Voorde ?., Van Heuverswyn H., Van Herreweghe J„ Volckaert G., Ysebaert M. Nature, 273, 113 (1978). 6. Van Henversuryn H., Fiers W. Eur. J. Biochem., 100, 50 (1979). 7. Sanger F., Coulson A. R., Friedmann Т., Air G. M., Barrett В. д., Brown N. L., Fiddes J. C, Hutchison C. ?., Slocombe P. M., Smith M. J. Mol. Biol., 125, 225 (1978). Маркеры молекулярной массы 377 8. Beck F., Sommer R., Auerswald ?. ?., Kurz Ch., link В., Osterburg G., Schaller H. Nucleic Acids Res., 5, 4495 (1978). 9. Grierson D. In: Gel Electrophoresis of Nucleic Acids — A Practical Approach, Rickwood D. and Hames B. D. (eds.), IRL Press Ltd., Oxford and Washington, DC, p. 1, 1982. 10. McConkey E., Hopkins J. J. Mol. Biol., 39, 545 (1969). 11. Stanley W. M., Bock R. M. Biochemistry (Wash.), 4, 1302 (1965). 12. Pearce Т. C, Rowe A. J., Turnock G. J. Mol. Biol., 97, 193 (1975). 13. Mondal H., Sutton ?., Chen V. J., Sarkar S. Biochem. Biophys. Res. Commun., 56, 988 (1974). 14. Berns ?., Jansson P., Bloemendal H. Biochem. Biophys. Res. Commun., 59, 1157 (1974). 15. Stravnezer J., Huang R. С. C, Stravnezer E., Bishop J. M. J. Mol. Biol., 88, 43 (1974). 16. Morrison M. R., Lingrel J. B. Biochim. Biophys. Acta, 447, 104 (1976). 17. Hamlyn P. H., Gould H. J. J. Mol. Biol., 94, 101 (1973). 18. Grunstein M., Schedl P. J. Mol. Biol., 104, 323 (1976). 19. Scazzochio C. Personal communication. 20. Brownlee G., Sanger F., Barrett B. G. J. Mol. Biol., 34, 379 (1968). 21. Loening U. E. J. Mol. Biol., 38, 355 (1968). 22. Hames B. D. In: Gel Electrophoresis of Proteins — A Practical Approach, Hames B. D. and Rickwood D. (eds.), IRL Press Ltd., Oxford and Washington, DC, p. 1, 1981. ПРИЛОЖЕНИЕ 11 ФИРМЫ — ПОСТАВЩИКИ ОБОРУДОВАНИЯ И РЕАКТИВОВ Многие крупные компании имеют дочерние фирмы в других странах, а большинство мелких фирм продает свои продукты через представителей. В следующем списке приведены, как правило, адреса главных отделений, по которым легко выяснить адрес регионального представителя той или иной фирмы. Amersham International Ltd., White Lion Road, Amersham HP7 9LL, Bucks., UK. BDH Chemicals Ltd., Poole BH12 4NN, Dorset. UK Beckman Instruments Inc., Spinco Division, Palo Alto, CA 94304, USA Bethesda Research Laboratories Inc. (BRL), P. O. Box 577, Gai- thersburg, M |
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 |
Скачать книгу "Транскрипция и трансляция. Методы" (6.57Mb) |
[каталог] [статьи] [доска объявлений] [обратная связь] |