Биологический каталог




Методы общей бактериологии. Том 2

Автор Ф.Герхардт

нты основных путей метаболизма

Путь метаболизма

Ключевые ферменты

Путь Эмбдена—Мейергофа — Парнаса (гликолитнческий путь) Гексозомонофосфатиыи и

пентозофосфатный пути Фосфокетолазный путь Путь Энтнера — Дудорова

Прямое окисление

Цикл трикарбоновых кислот (цикл Кребса), глноксилатный цикл

Метаболизм СОя

Киназы, фруктозо-1,6-бисфосфатальдолаза

Глюкозо-б-фосфат - дегидрогеназа,

трансальдолаза, транскетолаза Фосфокетолаза

Фосфо-2-кето-З-дезоксиглюконат — альдолаза Глюкозо- и глюконагдегидрогеназы

Цитрат-синтаза, цитрат — оксала-цетат-лиаза, аконитат-гидратаза, изоцитратдегидрогеназа, оксал-сукцинатдекарбоксилаза, а-кето-глутаратдегидрогеназа, липоил-редуктазотранссукцинилаза, ли-поамид-дегидрогеназа (NAD+), сукцинил-СоА — синтетаза, сук-цинил-СоА—гидролаза, фума-рат-гидратаза, малатдегидроге-наза, изоцитрат-лиаза, малат-синтаза, система пируватдегид-рогеназы

Различные карбоксилазы, декар-бокснлазы и т. д.

Прекрасное общее описание таких методов дано в книге «Methods in Microbiology». Специальная подробная информация, необходимая для выполнения таких методик, содержится в книге «Methods in Enzymology». Ключевые ферменты основных путей метаболизма с указанием соответствующих источников данных перечислены в табл. 18.3.

18.6. ЛИТЕРАТУРА

1. Arrigoni D., Singer Т. P. Nature (London), 183, 1256—1258 (1962).

2. Atkinson D. E. Cellular energy metabolism and its regulation, Academic Press, Inc., New York, 1977.

3. Bender R, A., Janssen K. A., Resnick A. D., Blumberg M.t poor F., Magasanik B. J. Bacteriol., 129, 1001—1009 (1977).

4. Buttin G. J. Mol. Biol., 7, 164—182 (1963).

5. Clarke P. H. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), Methods in microbiology, vol. 6A, p. 269—326, Academic Press, Inc., New York, 1971.

6. Coakley W. Т., Bater A. J., Lloyd D. Adv. Microb. Physiol., 16, 279—341 (1977).

7. Cota-Robles E. Stein S. In: A. I. Laskin and H. A. Lecheva-lier (ed.), Handbook of microbiology, vol. 2, p. 833—843, CRC Press, Cleveland, Ohio.

8. Dagley S., Chapman P. J. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), vol. 6A, p. 269—326, Academic Press, Inc., New York, 1971.

9. Decker L. A. (ed.). Worthington enzyme manual, Worthington Biochemicals Corp., Freehold, N. J., 1977.

10. Dobrogosz W. J. J. Bacterid., 91, 2263—2269 (1966).

11. Dobrogosz W, J. J. Bacterid., 95, 578—584 (1968).

12. Dobrogosz W. J. J. Bacteriol., 95, 585—591 (1968).

13. Dobrogosz W. J. J. Bacteriol., 97, 1083—1092 (1969).

14. Eaton N. R. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), Methods in microbiology, vol. 6B, p. 231—246, Academic Press, Inc., New York, 1972.

15. Eisenberg R. C, Dobrogosz W. J. J. Bacteriol, 93, 941—949 (1967).

16. Ferdinand W. The enzyme molecule. John "Wiley & Sons, Inc., New York, 1976.

17. Gachelin G. Biochem. Biophys. Res. Commun., 34, 382—387 (1969).

18. Hatfield G. W.f Umbarger H. E. Methods Enzymol., 17B, 561 —

566 (1971).

19. Hess B. In: H. H. Bergmeyer (ed.), Methods of enzymatic analysis, p. 43—55, Academic Press, Inc., New York, 1963.

20. Hirata M.t Tokushige M., Tnagaki A„ Hayaiski 0. J. Biol. Chem., 240, 1711—1717 (1965).

21. Holzer H., Duntze W. Annu. Rev. Biochem., 40, 345—374 (1971).

22. Hughes D. E., Wimpenny W. Т., Lloyd D. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), Methods in microbiology, vol. 5B, p. 1—54, Academic Press, Inc., New York, 1971.

23. Kaback H. R. Methods Enzymol., 22, 99—120 (1971).

24. Kingdom H. S., Stadtman E. R. J. Bacteriol., 94, 949—957 (1967).

25. Koch A. L. J. Mol. Biol., 59, 447—459 (1971).

26. Leive L. J. Biol. Chem., 243, 2373—2380 (1968).

27. Lowe R. H., Evans H. J. Biochim. Biophys. Acta, 85, 377—389 (1964).

28. Masters C. J. Curr. Top. Cell. Regul., 12, 75—105 (1977).

29. McClure W. R. Biochemistry, 8, 2782—2786 (1969).

30. Mecke D., Wutff K, Holzer H. Biochim. Biophys. Acta, 128, 559—

567 (1966).

31. Neidhardt F. С Boyd R. F. Cell biology: a laboratory text, Burgess Publishing Co., Minneapolis, Minn., 1965.

32. Neu H. C, Heppel L. A. J. Biol. Chem., 239, 3893—3900 (1964).

33. Neu H. C, Heppel L. A. J. Biol. Chem., 240, 3685—3692 (1965).

34. Pardee А. В., Jacob F.} Monod J. J. Mol. Biol., 1, 165—178 (1959).

35. Quayle J. R. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), Methods in

microbiology, vol. 6В, p. 157—183, Academic Press, Inc., New York, 1972.

36. Reeves H. C, Rabin R., Wegener W. S.t Ajl S. J. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), Methods in microbiology, vol. 6A, p. 425—462, Academic Press, Inc., New York, 1971.

37. Repaske R. Biochim. Biophys. Acta, 22, 189—191 (1956).

38. Roberts R. В., Abelson P. H., Cowie D. В., Bolton E. Т., Britten R. Studies of biosynthesis in Escherichia coli. Carnegie Inst. Washington Publ., 607 (1957).

39. Scruton M. C. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), Methods in microbiology, vol. 6A, p. 479—541, Academic Press, Inc., New York, 1971.

40. Shapiro B. M„ Stadtman E. R. Methods Enzymol., 17, 910—922 (1970).

41. Smyrniotis P. Z. Methods Enzymol., 5, 344—347 (1962).

42. Sols A., Reeves R. E., Gancedo C. In: E. H. Fischer, E. G. Krebs, H. Neurath, and E. R. Stadtman (ed.), Metabolic inconversion of enzymes, p. 393—399, Springer-Verlag, Berlin, 1973.

43. Sols A., Solas M. L. Methods Enzymol, 9, 436—442 (1966).

44. Stadtman E. R., Chock P. В., Adler S. P. In: S. Shaltiel (ed.), Metabolic interconversion of enzymes, p. 142—149, Springer-Verlag, Berlin, 1976.

45. Stadtman E. R., Smyrniotis P. Z., Davis J. N., Wittenberger M. E. Anal. Biochem., 95, 275—285 (1979).

46. Umbarger H. E. In: A. I. Laskin and H. A. Lechevalier (ed.), Handbook of microbiology, vol. 4, p. 35—42, CRC Press, Cleveland, Ohio, 1974.

47. Wang С. H. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), Methods in microbiology, vol. 6B, p. 185—230, Academic Press, Inc., New York, 1972.

48. White R. J. Biochem. J., 106, 847—858 (1968).

49. Wilson D. M., Alderte T. F., Maloney P. C, Wilson Т. H. J. Bacteriol., 126, 327—337 (1976).

50. Wood W. A. In: J. R. Norris and D. W. Ribbons (ed.), Methods in microbiology, vol. 6A, p. 411—424, Academic Press, Inc., New York, 1971.

51. Yamanka Wood W. A. Methods Enzymol., 9, 596—602 (1966).

Глава 19

ПРОНИЦАЕМОСТЬ И ТРАНСПОРТ

Р. Маркие

Хотя детали прохождения растворенных веществ через барьеры проницаемости бактериальных клеток на молекулярном уровне по существу неизвестны, все же можно различать процессы двух основных типов — пассивное проникновение и (активный) транспорт.

Проникновение — это пассивный переход растворенного вещества внутрь клетки (поглощение) или из клетки наружу (выделение) путем диффузии, которому может способствовать химическое взаимодействие между растворенным веществом и какой-либо клеточной структурой, например мембраной. Клетка может быть проницаемой или непроницаемой для данного вещества. Проницаемость— это свойство клетки, а не растворенного вещества. Проникновение растворенного вещества через клеточную мембрану можно описать уравнением

dS/d/=P4(AC),

где dS/dt— изменение количества растворенного вещества внутри клетки в единицу времени, Р — коэффициент проницаемости (с размерностью расстояние/время), Л — площадь мембраны и АС — разность концентраций растворенного вещества внутри и вне клетки. Если построить график, отложив внутреннюю концентрацию растворенного вещества (Свнутр) как функцию времени, то получится параболическая кривая, которая переходит в плато при Свньгр=^СВНешш т. е. когда внутренняя концентрация равна внешней или, точнее, когда активность растворенного вещества внутри клетки равна активности его вне клетки. Для такой кривой СВнутр = = (max СВнутр) (1—е~и), где k — константа, a t — время.

Транспорт — это процесс активного перемещения растворенного вещества в клетку или из клетки, который связан с метаболизмом и в котором могут участвовать энергизованные переносчики. У бактерий наиболее изучены два класса транспортных систем — фосфотрансферазные и так называемые пермеазные системы [15, 34]. Фосфотрансферазная система встречается главным образом у факультативных анаэробов и предназначена для транспорта Сахаров '[39], тогда как пермеазные системы для транспорта аминокислот, Сахаров, неорганических ионов и предшественников нуклеиновых кислот имеются почти у всех бактерий.

Кривая, описывающая ход поглощения растворенного вещества во времени, для процессов транспорта качественно не отличается от аналогичной кривой для пассивного проникновения. Однако активное поглощение не прекращается при СВНутр=Свнешн, а продолжается — теперь уже в форме так называемого концентрирующего транспорта — до тех пор, пока будет создан значительный градиент концентрации. Максимальное поглощение определяется соотношением между скоростями процессов, направленных внутрь и наружу.

Как уже говорилось, путем транспорта может осуществляться и выделение, и поглощение растворенных веществ клетками. Многие растворенные вещества транспортируются в ходе так называемой обменной диффузии, т. е. при обмене внутренних и наружных веществ через мембрану в соотношении 1 : 1. Такой обмен обычно изучают при помощи растворенных веществ с радиоактивной меткой [13].

Концентрирующее поглощение растворенных веществ не требует обязательного участия мембраны и транспортных катализаторов. Ионообменные смолы, например, способны поглощать и концентрировать ионы. Большинство органических компонентов клетки находятся не в водном растворе, а в твердых фазах клеточной стенки, мембран, рибосом, нуклеоида и т. д. и потому могут поглощать растворенные вещества так же, как смола. Этот аспект транспорта и проникновения растворенных веществ рассмотрен в обзоре Дамадьяна [12].

19.1. ПРОНИЦАЕМОСТЬ

19.1.1. Методика измерения

Проникновение растворенного вещества в бактериальные клетки или клеточные структуры чаще всего измеряют с помощью объемного метода или метода концентрированной взвеси, описанного Конвэем и Дауни [11] и модифицированного Митчеллом и Мойлом [32], Мак-Дональдом и Герхардтом [26] и другим

страница 78
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84

Скачать книгу "Методы общей бактериологии. Том 2" (4.15Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(16.06.2019)