![]() |
|
|
Гиперцикл. Принципы организации макромолекул143, 144 — с диффузией 248—252 трансляцией 151 — элементарные 128—124 Глобально инвариантное множество (подпространство, подсистема) 138 П см, Функции чистого роста Игровые модели 48, 49, 54—60, 83—90 Избыточная продуктивность (Ei) 35 Изинга модель 197 Информационное содержание 50—54 Источник 101—105 Катастрофа ошибок 53, 54, 56, 81 «Качания» (wobble, wobbling) 62 — в третьем положении кодона 204 — основания 202 — эффект 207 «Качающиеся» взаимодействия 198, 208 — основания 203 — положения в мРНК 203 Качества фактор (Q<) 34, 51, 52, 61, 63, 64, 68, 69, 72, 78 Качество копирования буквы среднее {qm) 41, 51, 52 Квазивид 37—46, 50—54 157—164, 240, 251 Колебания 86, 87, 146—151, 157—164, 240, 251 Компартмеитация 83, 245, 246, 256 Конкуренция между гиперциклами 163—167 Концентрация суммарная (полная, общая) 106 Ляпунова функция 139—142 нестрогая (в слабом смысле) 141 строгая (strict) 141 Метаболизм 29, 31 Михаэлиса — Ментен механизм 19, 46, 154 Мутантная копия с многими ошибками 42, 43, 229 одной ошибкой 42, 43, 45 229 Мутации 15, 16, 32, 34, 35 — нейтральные 43, 45, 49, 50 Нормальные моды 109—111 Нуклеозидтрифосфаты 23, 154 Ограничение «постоянной общей организации» 35, 36, 96 Оптимизационный принцип 17, 38, 39 Особые точки, исследование 88, 100, 101 карта 101—106 классификация 104 Ошибок темп 35, 61, 78, 198, 199 Паразитная связь 167—172 Полимеризация матричная 152 Популяционная генетика 15, 16, 29, 50, 54 Популяционные переменные Ы 34, 91 нормированные (&) 99, 106 Порог ошибок 53, 54, 78 Поток (flow) индвидуальный (0i) 34, 35 — суммарный (общий) (Ф*) 35 Ф 95, 96 Потоки (fluxes) обобщенные постоянные 95 Превосходства параметр (ат) 41, 44, 53 Предельный цикл 103, 106, 109, ПО, 130, 146—151, 157, 160, 163 Прокариотическая клетка 72, 78, 230, 232, 258 Пространство параметров 91 Проточный реактор 36, 151 Р, матрица показатели P%i 127 pi, степень ведущего члена функции роста Г[ 95 p%i, показатели степени членов функции роста Г* 127 Реакционная сеть циклическая 27 Реакционный цикл 18 каталистический 21—23 Ребро особых точек 138, 143 — текущее 138, 143, 144 Рекомбинация генетическая 70—73 Репарации механизм 67—73 Репликационная вилка 66, 67 Решение «раз и навсегда» 18, 97, 98, 165 Рибонуклеаза 239 Рибосома 179, 181, 232, 257 РНК, модель цветка 76 — репликация 21, 23, 26, 60— 65, 78 26, 60—65, 78 — репликаза фагоспецифичная 26, 60—65, 78 — самокопирование внутренних областей 227, 236 Рибосома — синтез de novo 235—237 — содержащий фаг QA 40, 41, 60—65, 78, 198, 243 — — . размножение 26, 60—65 — фага Qfi, мидивариант 62, 64, 76, 191, 236, 237 Рост гиперболический 27, 93, 94, 97, 165 — линейный 23, 46, 93, 94, 96, 97 — неограниченный 92—95, 165 — с ограничениями 95 — экспоненциальный 23, 46,93, 94 Самовоспроизведение 22, 23 Седло 101—105 Селективная ценность (W«) 36, 38, 44, 45, 61, 84, 86, 90, 92 Селекционные ограничения 15, 34—36,48,95—98 Сепаратриса 101—103 Серийные переносы 36, 61 Силы обобщенные постоянные 95 Симплекс концентраций 106— ь 109 внутренняя часть 138 — — граница 138, 139 Сингулярность кинетической кривой 93, 94 фштетазные функции 183, 194, 239—243 ?-Слой 237, 238 Собственные векторы 38, ПО — значения 38, 44, 104, ПО Степень полимеризации максимальная (vmax) 41, 53, 55, 72, 78 Сток 101—104 Стопка оснований кооперативная 196 Стохастическая теория 44, 48— 50 Таргетиая функция 245 Теория возмущений 44 — катастроф 113 Траектории 101, 109 Уравновешивание внутреннее 98-100 Устойчивость асимптотичская 130, 141 Феноменологические уравнения 34, 90 Фенотип 39, 58, 62, 80, 82, 118, 177, 244, 257 Флуктуация 49, 103—105, 130, 143, 253 Функция чистого роста (Г*) 92, 93, 96, 99, 111, 113, 127, 128 однородная 99, 100, 112, 127 Ф(, Фи Ф1 Ф см. Поток Хиральность 15 «Цель» (target) 58 Цепи каталитические 118— 124 Цикл каталитический 22, 23 — трикарбоновых кислот 20 — углеродный 19 Эволюционные эксперименты 35, 60—65, 215 Эволюционный принцип для гиперциклов 219, 222—226 Эволюция, исторический путь 15—18, 58 — недарвиновская 45, 46, 165 Экологические ниши 94, 245 Экстрацистронные области 62 Экстремальный принцип 38, 39 Эукариотическая клетка 72,73, 78 Якобы матрица ПО, 137 СОДЕРЖАНИЕ Предисловие редакторов перевода .... 5 Предисловие , 8 Часть А. Возникновение гиперцикла . . ., 15 I. Парадигма единства и разнообразия в эволюции . . 15 II. Что такое гиперцикл? , , 18 III. Дарвиновские системы 29 III. 1. Принцип естественного отбора 29 III. 2. Необходимые предпосылки возникновения дарвиновских систем 30 III. 3. Динамика отбора .34 III. 4. Концепция квазивида 37 III. 5. Реалистические аппроксимации 44 III. 6. Обобщения 46 III. 7, Информационное содержание квазивида ... 50 IV. Порог ошибок и эволюция 54 IV. 1, Моделирование на ЭВМ катастрофы ошибок . . 54 IV. 2, Экспериментальные исследования с РНК-содержащими фагами 60 IV. 3. Репликация ДНК 65 IV. 4. Первые репликативные единицы .73 IV. 5. Необходимость возникновения гиперциклов . . 77 Часть Б. Абстрактный гиперцикл 80 V. Конкретный пример 80 VI. Общая классификация динамических систем .... 90 VI. 1. Определения 90 VI. 2. Неограниченный рост . . . , 92 VI. 3. Ограниченный рост и отбор 95 VI. 4. Внутреннее уравновешивание в растущих системах 98 VII. Исследование особых точек самоорганизующихся се-тей реакций 100 VII. 1. Адекватный метод исследования 100 VII. 2„ Топологические свойства 101 VII. 3. Адекватное пространство: симплекс концентраций 106 VII. 4. Исследование нормальных мод 109 VII. 5. Растущие системы Ill VII. 6. Анализ конкретных систем ИЗ VII. 7, Исследование особых точек гиперциклов . .125 VIII. Динамика элементарного гиперцикла 137 VIII. 1. Качественный анализ 137 VIII. 2. Численное интегрирование 145 IX. Гиперциклы с трансляцией 151 IX. 1. Идеальные граничные условия и общие упрощения 151 IX. 2. Кинетические уравнения 152 IX. 3. Численные решения 156 X. Сети гиперциклов 163 X. I. Внутреннее уравновешивание и конкуренция между гиперциклами 163 X. 2. Паразитная связь и каталитические сети .... 167 X. 3. Иерархия связей между гиперциклами .... 172 Выводы 175 Часть В. Реалистический гиперцикл 179 XI. Как могла зародиться трансляция? . , 179 XII. Логика первичного кодирования 185 XII. 1. Код RRY 185 XII. 2. Код RNY 190 XIII. Физика первичного кодирования 193 XIII. 1. Условия на старте 193 XIII. 2. Распространенность нуклеотидов ...... 195 XIII. 3. Стабильность комплементарных структур . .196 XIV. Код с GC-рамкой 202 XIV. 1. Первые два кодона 202 XVI. 2. «Апериодическая линейная GC-решетка» . . . 205 XIV. 3. От GNC к RNY 206 XIV. 4. Первичный алфавит аминокислот ..... 208 XV. Гиперциклическая организация раннего аппарата трансляции 215 XVI. Десять вопросов, касающихся наших самых ранних молекулярных предков и тех следов, которые они оставили в биосинтетическом аппарате современных клеток 226 XVI. 1. Один РНК-предшествениик? 226 XVI. 2. Что означает селективное преимущество для молекулы? 227 XVI, 3. Почему нужна гиперциклическая организация отдельных мутантных генов, а не один постоянно растущий геном? 228 XVI. 4. Необходимы ли при старте тРНК? 230 XVI, 5. Дают ли современные тРНК какие-либо указания на свое происхождение? 232 XVI, 6. Как в информационной РНК могли возникнуть кодонные паттерны без запятых? . . . 235 XVI. 7. Какими были первые функционально активные белки? 237 XVI. 8. Необходимы ли при старте синтетазы? . - - 239 XVI. 9. Какими были первые ферменты? 241 XVI. 10. Почему же в конечном счете — клетки с объединенными геномами? - , 243 XVII, Реалистические граничные условия ...... 247 XVIII. Непрерывность эволюции 254 Литература 261 Предметный указатель 265 УВАЖАЕМЫЙ ЧИТАТЕЛЬ! Ваши замечания о содержании книги, ее оформлении, качестве перевода и другие просим присылать по адресу: 129820, Москва, И-ПО, ГСП 1-й Рижский пер., д. 2, издательство «Мир» |
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 |
Скачать книгу " Гиперцикл. Принципы организации макромолекул" (2.15Mb) |
[каталог] [статьи] [доска объявлений] [обратная связь] |