Биологический каталог




Ферменты. Том 1

Автор М.Диксон, Э.Уэбб

ых кислот

3.1.6. Гидролазы эфиров серной кислоты

3.1.7. Гидролазы дифосфомоноэфи-ров

3.1.11. Экзодезоксирибоиуклеазы, образующие 5 -фосфомоноэфиры

3.1.13. Экзорибонуклеазы, образующие 5'-фосфомоноэфиры

3 1.14. Экзорибонуклеазы, образующие другие (ие 5'-) фосфомоноэфиры

Продолжение таблицы 5.1

3.1.15. Экзонуклеазы, действующие как иа рибо-, так и на дезоксирибоиуклеиновые кислоты с образованием 5'-фос-фомоиоэфиров

3.1.16. Экзонуклеазы, действующие как иа рибо-, так и на дезоксирибоиуклеиновые кислоты с образованием других (не 5'-) фосфомоиоэфиров

3.1.21. Эндодезоксирибонуклеазы, образующие 5 -фосфомоноэфиры

3 1.22. Эндодезоксирибонуклеазы,

образующие другие (не 5'-) фосфомоноэфиры

3.1.23. Эндодезоксирибонуклеазы сайт-специфичные; специфичны к последовательности

3.1.24. Эндодезоксирибонуклеазы сайт-специфичные; неспеци-фичиы к последовательности

3.1.25. Эндодезоксирибонуклеазы сайт-специфичиые; специфичны к измененным основаниям

3.1.26. Эидорибоиуклеазы, образующие 5'-фосфомоноэфиры

3.1.27. Эидорибоиуклеазы, образующие другие (не 5'-) фосфомоноэфиры

3.1.30. Эидонуклеазы, действующие как иа рибо-, так и иа дезоксирибоиуклеиновые кислоты с образованием 5'-фосфомо-иоэфиров

3.1.31. Эидонуклеазы, действующие как на рибо-, так н иа дезоксирибоиуклеиновые кислоты с образованием других (не 5'-) фосфомоиоэфиров

3.2. Действуют иа гликозильные соединения

3.2.1. Гидролизуют О-гликозильные соединения

3.2.2. Гидролизуют N-гликозильные соединения

3 2.3. Гидролизуют S-гликознльные . соединения

3.3. Действуют иа простые эфирные связи

3 3.1. Гидролазы тиоэфиров

3 3 2 Гидролазы простых эфиров

3.4. Действуют иа пептидные связи (пептид-гидролазы)

3.4 11. а-Амииоацилпептид — гидролазы

3.4.12. Гидролады пептидиламиио-кислот или гидролазы ацила-мииокислот

3.4.13. Дипептид — гидролазы

3.4.14. Днпептидилпептид — гидролазы

3.4.15. Пептидилдипептид — гидролазы

3.4.16. Серииовые карбоксипептида-зы

3.4.17. Металлокарбоксипептидазы

3.4.21. Серииовые протеииазы

3.4.22. Тиоловые протеииазы

3.4.23. Кислые протеииазы

3.4.24. Металлопротеииазы

3.4.99. Протеииазы с неизвестным механизмом катализа

3.5. Действуют иа С — N-связн, отличающиеся от пептидных связей

3.75.1. Действуют иа лииейиые амиды

3.5.2. В циклических амидах

3.5.3. В лииейиых амидииах

3.5.4. В циклических амидииах

3.5.5. В нитрилах

3.5.99. В других соединениях

3.6. Действуют на ангидриды кислот

3.6.1. В фосфорилсодержащих ангидридах

3.6.2. В сульфоиилсодержащих ангидридах

3.7. Действуют на С — С-связи 3.7.1. В кетосоединениях

3.8. Действуют на галоядиые связи

3.8.1. В С-галоидиых соединениях

3.8.2. В Р-галоидных соединениях

3.9. Действуют на Р — N-связн :3.10. Действуют на S—N-связн 3.11. Действуют на С — Р-связи

4. ЛИАЗЫ

4Л. Углерод — углерод лиазы

4.1.1. Карбокси-лиазы

4.1.2. Альдегид — лиазы

4.1.3. Лиазы оксокислот

4.1.99. Прочие углерод — углерод лиазы

Продолжение таблицы 5.1

4.2. Углерод — кислород лиазы

4.2.1. Гидро-лиазы

4.2.2. Действуют на полисахариды 4.2.99. Прочие углерод — кислород

лиазы

4.3. Углерод — азот лиазы

4.3.1. Аммиак-лиазы

4.3.2. Амидин-лиазы

4.4. Углерод — сера лиазы

4.5. Углерод — галоид лиазы

4.6. Фосфор — кислород лиазы 4.99. Прочие лиазы

5. ИЗОМЕРАЗЫ

5.1. Рацемазы и эпимеразы

5.1.1. Действуют на аминокислоты и их производные

5.1.2. Действуют иа гидроксикисло-ты и их производные

5.1.3. Действуют на углеводы и их производные

5.1.99. Действуют иа прочие соединения

5.2. Цис-транс-изотр&зы

5.3. Внутримолекулярные оксидоре-дуктазы

5.3.1. Взаимопревращают альдозы и кетозы

5.3.2. Катализируют взаимопревращения кетонных и еиольиых групп

5.3.3. Перемещают С = С-связи 5 3.4. Перемещают S—S-связи 5.3.99 Другие внутримолекулярные

оксидоредуктазы

5.4. Внутримолекулярные трансфе-разы

5.4.1. Перемещают ацильиые группы

5.4 2. Перемещают фосфоэфириые группы

5.4 3. Перемещают аминогруппы 5.4.99. Перемещают другие группы

5.5. Внутримолекулярные лиазы 5.99. Прочие изомеразы

Классификация ферментов 6. ЛИГАЗЫ (синтетазы) Образуют С—0-связи

б. 1.1. Лигазы, образующие амино-

ацил-тРНК и родственные соединения

в. 2. Образуют С — S-связи

6.2.1. Кислота-тиол лигазы

6.3. Образуют С — N-связи

Продолжение таблицы 5.1

6.3.1. Кислота — аммиак (или амин) лигазы (амид-сиитета-зы)

6.3.2. Кислота — аминокислота лигазы (пептид-синтетазы)

6.3.3. Цикло-лигазы

6.3.4. Прочие С — N лигазы

6.3.5. С — N лигазы с глутамином в роли амидо-М-донора

6.4. Образуют С — С-связи

6.5. Образуют фосфоэфирные связи-

В табл. 5.1 дан ключ к системе нумерации и классификации ферментов. Все четырехкомпонентные коды и соответствующие названия официально приняты Международным биохимическим союзом.

ПРАВИЛА КЛАССИФИКАЦИИ И НОМЕНКЛАТУРЫ

В [1266] приведена сводка правил для построения рекомендуемых, а также систематических названий. Комиссия по> биохимической номенклатуре следовала этим правилам при составлении названий, приведенных в Списке ферментов; они могут быть использованы для построения названий новых ферментов. Эти правила приведены ниже полностью.

а) ОБЩИЕ УКАЗАНИЯ И ПРАВИЛА1

Общие указания относительно рекомендуемых названий

1. В названиях ферментов допустимо употребление общепринятых тривиальных названий субстратов. Буквы D у обычных Сахаров и L у обычных аминокислот опускаются (если это не приводит к неоднозначности). Для обозначения положения заместителей вместо номеров можно использовать буквы а, р\ у...

Правила для систематической номенклатуры, на которой основана классификация

1. Чтобы систематические наименования ферментов небыли излишне громоздкими,, допускается использование в-> них общепринятых тривиальных названий субстратов. В случаях, где не существует принятых и удобных тривиальных названий, субстраты должны обозначаться согласно официальным правилам но-

1 В некоторых правилах приведены дополнения, обусловленные правилаз-ми написания ферментов на русском языке. — Прим. перев. Глава 5

там,' где в настоящее время принят этот способ обозначения. Как правило, в рекомендуемых названиях нет надобности указывать положение заместителей (если это не требуется во избежание обозначения разных ферментов одним названием).

менклатуры МСТПХ (Ш-РАС). Для указания положения заместителей следует применять номерную систему (1,2,3...), а не буквенную (а, В,у...). Буквы аир используются для обозначения конфигураций, хотя допустимы такие обозначения групп, как В-аспартил, у-глутамил, В-ала-нин. Остатки нуклеотидов обозначаются наименованиями типа аденилил (не аденил) и т. д. Название оксокислоты (не кетокислоты) применяется как общее для всего класса соединений. В названиях отдельных соединений, в которых группа —СН2— заменена группой —СО—, следует употреблять префикс оксо; префикс кето применяется для производных Сахаров, у которых на месте группы —СНОН— стоит —СО—.

2. В тех случаях, когда субстрат в нормальных условиях находится в форме аниона, в наименовании фермента указывается анион (его название с окончанием ат, а не ико), например «лактатдегидрогеназа», а не «лактикодегидрогеназа» или «дегйдрогеназа молочной кислоты».

3. Общепринятые сокращенные названия субстратов, например АТР, могут применяться в названиях ферментов, однако следует воздерживаться от введения новых сокращений, не вошедших в число рекомендованных КБН (Комиссией Ш РАС—ШВ по биохимической номенклатуре). Химические формулы (например, 02) не должны применяться вместо названий субстратов (например, кислород). Не следует пользоваться сокращениями вместо рекомендуемых названий ферментов; так, нельзя писать ГД или ГДГ вместо глутаматдегидрогеназа или глюкозодегидрогеназа и т. п.

4. (Применительно к номенклатуре на русском языке необходимые дополнения даны А. Браунштейном.) Часть систематического названия, которая включает в себя названия субстратов и может содержать разделительные знаки (дефисы, знаки деления и т. п.), пишется раздельно от второй части наименования, указывающей тип реакции, или же соединяется с

Классификация ферментов ней знаком связи (длинной черточкой), но не дефисом; пример: глюкозо-6-фоофат: NADP+ оксидоредуктаза или глюко-зо-6-фосфат: NADP+ — оксидоредуктаза. В тривиальной номенклатуре название субстрата и тип фермента можно писать слитно, если в первой или второй части термина нет разделительных знаков; в противном случае между ними ставится дефис или (для ясности) знак связи, например: глюкозодегид-рогеназа, но глюкозо-6-фосфат — дегидрогеназа; ацетил-СоА — синтетаза и ацетат — СоА-трансфераза; гистидиндекарбоксила-за, но аспартат — В-декарбоксилаза. Дефис и знак связи допустимо применять и в других случаях для расчленения громоздких, труднопроизносимых

страница 66
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88

Скачать книгу "Ферменты. Том 1" (3.77Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(07.12.2019)